Федоренко Віктор Олександрович

Посада: завідувач кафедри генетики та біотехнології

Науковий ступінь: доктор біологічних наук

Вчене звання: професор

Телефони (робочі): 239-47-68, 239-44-07, (032) 239-44-75

Електронна пошта: viktor.fedorenko@lnu.edu.ua

Профіль у Google Scholar: scholar.google.com.ua

Профіль у Scopus: www.scopus.com

Профіль у Web of Science (Publons): publons.com

Наукові інтереси

Наукові інтереси:

  • Генетика, селекція і генетична інженерія актинобактерій.
  • Генетичний контроль біосинтезу антибіотиків та стійкості до антибіотиків.
  • Механізми регулювання експресії геному бактерій.

Науковий керівник:

  • НДЛ-42 генетики, селекції та генетичної інженерії продуцентів біологічно активних речовин.
  • Колекції культур мікроорганізмів-продуцентів антибіотиків ЛНУ імені Івана Франка.

Дис… канд. біол. наук: “Генетична нестабільність ознак стійкості до антибіотиків у Strepomyces coelicolor A3(2)”, 1981 р., Всесоюзний науково-дослідний інститут генетики та селекції промислових мікроорганізмів (Москва). Спеціальність 03.00.15 – генетика. Науковий керівник: проф. Ломовська Н.Д.

Дис… д-ра біол. наук: “Генетичний контроль стійкості актиноміцетів до антибіотиків та його роль у біосинтезі антибіотиків”, 2005 р., Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України (Київ). Спеціальність 03.00.15 – генетика.

Науковий керівник і консультант захищених дисертацій, кандидатських: Настасяка І.М., Кириченко Н.В., Заворотної С.А., Голець Л.М., Демидчук Ю.О., Дубицької Л.П., Осташа Б.О., Лужецького А.М., Ребця Ю.В., Громика О.М., Осташ І.С., Климишина Д.О. , Горбаль Л.О., Кобилянського А.М., Мироновського М.Л., Макітринського Р.П., Ющука О.С., Шиманської І.Є. та докторської Осташа Б.О.

Публікації

  • Профіль в Scopus:

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=7103033524

  • Профіль в Researchgate:

https://www.researchgate.net/profile/Victor_Fedorenko

  • Cписок публікацій в Pubmed:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Fedorenko+V

 

Монографії:

  1. Осташ Б., Ющук О., Осташ І., Рабик М., Федоренко В. Біологія антибіотиків – інгібіторів синтезу клітинної стінки бактерій– Львів : ЛНУ імені Івана Франка, 2018 – 235 с.
  2. Ostash B., Yan X., Fedorenko V., Bechthold A. Chemoenzymatic and bioenzymatic synthesis of carbohydrate containing natural products. In “Natural products via enzymatic reactions”. Top. Curr. Chem., Vol. 297: Ed. J. Piel. – Springer-Verlag Berlin Heidelberg : 2010. – P. 105–148.

 

Вибрані публікації у періодичних виданнях за 2003-2024 роки:

    1. Kachor A., Tistechok S., Rebets Y., Fedorenko V., Gromyko O. Bacterial community and culturable actinomycetes of Phyllostachys viridiglaucescens rhizosphere// Antonie Van Leeuwenhoek, 2024. – 117(1):9. doi: 10.1007/s10482-023-01906-0.
    2. Yushchuk O., Binda E., Rückert-Reed C., Berini F., Fedorenko V., Kalinowski J., Marinelli F.Actinoplanes oblitus nov., producing the glycopeptide antibiotic A477 // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2024. – Vol. 74(1). doi: 10.1099/ijsem.0.006225.
    3. Zhukrovska K., Binda E., Fedorenko V., Marinelli F., Yushchuk O.The impact of heterologous regulatory genes from lipodepsipeptide biosynthetic gene clusters on the production of teicoplanin and A40926 // Antibiotics, 2024. – 13(2):115. doi: 10.3390/antibiotics13020115.
    4. Dolya B., Hryhorieva O., Sorochynska K., Lopatniuk M., Ostash I., Tseduliak V.-M., Sterndorff E.B., Jørgensen T.S., Gren T., Dacyuk Y., Weber T., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Ostash B. Properties of multidrug-resistant mutants derived from heterologous expression chassis strain Streptomyces albidoflavus// Microorganisms, 2023. – Vol.11(5):1176. doi: 10.3390/microorganisms11051176.
    5. Tistechok S., Roman I., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Gromyko O. Diversity and bioactive potential of Actinomycetia from the rhizosphere soil of Juniperus excelsa //Folia Microbiol., 2023. –  Vol. 68(4). – P. 645–653. doi: 10.1007/s12223-023-01047-x.
    6. Tseduliak V.-M., Dolia B., Ostash I., Lopatniuk M., Busche T., Ochi K., Kalinowski J., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Ostash B. Mutations within gene XNR_2147 for TetR-like protein enhance lincomycin resistance and endogenous specialized metabolism of Streptomyces albus// J. Appl. Genet., 2023. – Vol. 64(1). – P. 185-195. doi: 10.1007/s13353-022-00738-4
    7. Оstash B., Stanchak K., Gren T., Fedorenko V. Genetic analysis of sulfate assimilation gene cluster of Streptomyces coelicolor A3(2)// Фактори експериментальної еволюції організмів, 2023. –  32 – С. 64–68.  doi: https://doi.org/10.7124/FEEO.v32.153
    8. Yushchuk O., Heterologous expression reveals ancient properties of Tei3 –a VanS ortholog from the teicoplanin producer Actinoplanes teichomyceticus / Yushchuk , K. Zhukrovska, B. Ostash, V. Fedorenko, F. Marinelli // Int. J. Mol. Sci., 2022. –  23, 15713. https://doi.org/10.3390/ijms232415713.
    9. Ostash B., Makitrynskyy R., Yushchuk O., Fedorenko V. Structural diversity, bioactivity, and biosynthesis of phosphoglycolipid family antibiotics: Recent advances  //  BBA Advances. –  2022, 2, 100065. https://doi.org/10.1016/j.bbadva.2022.100065
    10. Syrvatka V., Rabets A., Gromyko O., Luzhetskyy A., Fedorenko V. Scandium-microorganism interactions in new biotechnologies // Trends in biotechnology. – 2022 – 40, 9 – P. 1088–1101. –  https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2022.02.006.
    11. Tistechok S., Myronovskyi M., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Gromyko O. Screening of thiopeptide-producing Streptomycetesisolated from the rhizosphere soil of Juniperus excelsa // Current Microbiology. – 2022 – 79 –305. – https://doi.org/10.1007/s00284-022-03004-2 .
    12. Yushchuk O., Zhukrovska K., Berini F., Fedorenko V., Marinelli F. Genetics behind the glycosylation patterns in the biosynthesis of dalbaheptides // Frontiers in Chemistry. – 2022 – 10 – 858708 (1-9). – doi:10.3389/fchem.2022.858708.
    13. Melnyk S., Stepanyshyn A., Yushchuk O., Mandler M., Ostash I., Koshla O., Fedorenko V., Kahne D., Ostash B. Genetic approaches to improve clorobiocin production in Streptomyces roseochromogenes NRRL 3504 // Appl. Microbiol. Biotechnol., 2022– 106, 4 – P. 1543–1556. – doi: 10.1007/s00253-022-11814-4.
    14. Shemediuk A., Dolya B., Ochi K., Fedorenko V., Ostash B. Properties of spontaneous rpsLmutant of Streptomyces albus KO-1297 // Cytology and Genetics. – 2022– 56, 1 – P. 31–36. – doi: 10.3103/S009545272201011X.
    15. Yushchuk O., Binda E., Fedorenko V., Marinelli F. Occurrence of vanHAX and related genes beyond the Actinobacteria phylum // Genes – 2022, 13, 1960. https://doi.org/10.3390/10.3390/genes 13111960.
    16. Tseduliak V.M, Dolia B., Ostash I., Lopatniuk M.,Busche T., Ochi K., Kalinowski J., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Ostash B. Mutations within gene XNR_2147 for TetRlike protein enhance lincomycin resistance and endogenous specialized metabolism of Streptomyces albus J1074 // Journal of Applied Genetics – 2022. –https://link.springer.com/article/10.1007/s13353-022-00738-4
    17. Ющук O. , Жукровська К., Федоренко В. Філогенія білків-експортерів глікопептидних і деяких споріднених антибіотиків // Вісник біологічного факультету. Серія біологічна. – 2022. – Вип. 86 – С. 33-46. – doi: 10.30970/vlubs.2022.86.03.
    18. Ющук О.C, Жукровська К.А., Федоренко В.О. Поширення кластерів генів біосинтезу комлестатину та подібних сполук у представників роду Streptomyces // Фактори експериментальної еволюції організмів. -2022. – Том. 30 – С. 133-140. – doi: 0.7124/FEEO.v30.1474.
    19. Andreo-Vidal A., Binda E., Fedorenko V., Marinelli F., Yushchuk O. Genomic insights into the distribution and phylogeny of glycopeptide resistance determinants within the Actinobacteria phylum // Antibiotics. – 2021 – 10, 12 – 1533 (1-30) – doi: 10.3390/antibiotics10121533.
    20. Yushchuk O., Ostash I., Mösker E., Vlasiuk I., Deneka M., Rückert C., Busche T., Fedorenko V., Kalinowski J., Süssmuth R.D., Ostash B. Eliciting the silent lucensomycin biosynthetic pathway in Streptomyces cyanogenusS136 via manipulation of the global regulatory gene adpA // Scientific Reports – 2021. – 11(1):3507. doi: 10.1038/s41598-021-82934-6
    21. Syrvatka,Karachkovska A., Gromyko O., Kulyk N.,  Fedorenko V. Synthesis and properties of silver nanoparticles-antibiotic conjugates for study of antibiotic-resistance mechanisms // Optical Engineering – 2021. – 60(3), 037101. https://doi.org/10.1117/1.OE.60.3.037101/
    22. Koshla O., Lopatniuk M., Borys O., Misaki Y., Kravets V., Ostash I., Shemediuk A., Ochi K., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Ostash B. Genetically engineered rpsLmerodiploidy impacts secondary metabolism and antibiotic resistance in Streptomyces // World J. Microbiol. Biotechnol. – 2021. – 37(4):62. doi: 10.1007/s11274-021-03030-5
    23. Tistechok S.I., Tymchuk I.V., Korniychuk O.P., Fedorenko V.O., Luzhetskyy A.M., Gromyko O.M. Genetic identification and antimicrobial activity of Streptomyces strain Je 1–6 isolated from rhizosphere soil of Juniperus excelsa Bieb //Cytology and Genetics – 2021. – Vol. 55, No. 1, – P. 28–35. DOI: 10.3103/S0095452721010138
    24. Vasylechko V., Fedorenko V., Gromyko O., Gryshchouk G.,Kalychak Ya., Tistechok S., Us I., Тupys A. A novel solid-phase extraction method for preconcentration of silver and antimicrobial properties of the Na-clinoptilolite–Ag composite// Materials Today: Proceedings – Vol. 35. P. 548–551. https://doi.org/10.1016/j.matpr.2019.10.049
    25. Yushchuk O., Ostash B., Truman A.W., Marinelli F., Fedorenko V. Teicoplanin biosynthesis: unraveling the interplay of structural, regulatory, and resistance genes // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2020. – Vol. 104. – P. 3279–3291. doi: 10.1007/s00253-020-10436-y
    26. Yushchuk O., Homoniuk V., Datsiuk Y., Ostash B., Marinelli F., Fedorenko V. Development of a gene expression system for the uncommon actinomycete Actinoplanes rectilineatusNRRL B-16090 // J. Appl. Genet. – 2020. – Vol. 61. – P. 141–149. doi: 10.1007/s13353-019-00534-7
    27. Yushchuk O., Homoniuk V., Ostash B., Marinelli F., Fedorenko V. Genetic insights into the mechanism of teicoplanin self-resistance in Actinoplanes teichomyceticus// J. Antibiot. – 2020. – Vol. 73. – P. 255–259. doi: 10.1038/s41429-019-0274-9
    28. Vasylechko V.O., Fedorenko V.O., Gromyko O.M., Gryshchouk G.V., Kalychak Y.M., Tistechok S.I., Us I.L., Tupys A. Sorption рreconcentration of silver for atomic absorption analysis and antibacterial properties of the acid-modified clinoptilolite – Ag composite // Methods and objects chem. analysis – 2020. – Vol. 15, No. 2. – P. 73–82. https://doi.org/10.17721/moca.2020.73-82
    29. Ostash B.O., Misaki Y., Dolya B., Kharaton Y., Busche T., Luzhetskyy A., Kalinowski J., Ochi K., Fedorenko O. Generation and initial characterization of a collection of spontaneous Streptomyces albusj1074 mutants resistant to rifampicin / / Фактори експериментальної еволюції організмів: зб. наук. пр. – К.: Укр. т-во генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова, 2020. – Т. 27. – С. 139–143. DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v27.1316
    30. Lopatniuk M., Myronovskyi M., Nottebrock A., Busche T., Kalinowski J., Ostash B., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Effect of “ribosome engineering” on the transcription level and productionof S. albusindigenous secondary metabolites // Microbiol. Biotechnol. – 2019. – Vol. 103, № 17. – P. 7097–7110. doi: 10.1007/s00253-019-10005-y.
    31. Yushchuk O., Horbal L., Ostash B., Marinelli F., Wohlleben W., Stegmann E., Fedorenko V. Regulation of teicoplanin biosynthesis: refining the roles of tei cluster-situated regulatory genes // Microbiol. Biotechnol. – 2019. – Vol. 103, № 10. – Р. 4089–4102. doi: 10.1007/s00253-019-09789-w.
    32. Kuzhyk Y., Lopatniuk M., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Ostash B. Genome engineering approaches to improve nosokomycin A production by Streptomyces ghanaensis3 // Indian J. Microbiol. – 2019. – Vol. 59, № 1. – Р. 109-111. doi: 10.1007/s12088-018-0761-x.
    33. Sehin Y., Koshla O., Dacyuk Y., Zhao R., Ross R., Myronovskyi M., Limbach P.A., Luzhetskyy A., Walker S., Fedorenko V., Ostash B. Gene ssfg_01967 (miaB) for tRNA modification influences morphogenesis and moenomycin biosynthesis in Streptomyces ghanaensisATCC14672 // Microbiology – 2019. – Vol. 165, Is. 2. – P. 233-245. doi: 10.1099/mic.0.000747.
    34. Koshla O.T., Rokytskyy I.V., Ostash I.S., Busche T., Kalinowski J., Mösker E., Süssmuth R.D., Fedorenko V.O., Ostash O. Secondary metabolome and transcriptome of Streptomyces albus J1074 in liquid medium SG2 // Cytology and Genetics– 2019. – Vol. 53,  1. – P 1–7. https://doi.org/10.3103/S0095452719010080
    35. Kuzhyk Y., Rebets Y., Popko I., Ostash I., Walker S., Fedorenko V., Ostash B. Tn5-based transposon mutagenesis of Streptomyces ghanaensisATCC14672: searching for novel regulators of moenomycin production // Visnyk of the Lviv University. Biol. Ser. – 2019. – Vol. 81. – P. 50–56. DOI: http://dx.doi.org/10.30970/vlubs.2019.81.06
    36. Mutenko H.V., Ostash B.O., Rothballer M., Weiss A., Schmid M., Hartmann A., Fedorenko V.O. Microbe-plant interactions between Streptomycesand model agricultural plants – Hordeum vulgare and Lycopersicon esculentum (Microtom) // Фактори експериментальної еволюції організмів: зб. наук. пр. – К.: Укр. т-во генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова, 2019. – Т. 25. – С. 137–141. https://doi.org/10.7124/FEEE.v1154
    37. Yushchuk O., Ostash I., Vlasiuk I., Gren T., Luzhetskyy A., Kalinowski J., Fedorenko V., Ostash B. Heterologous AdpA transcription factors enhance landomycin production in Streptomyces cyanogenusS136 under a broad range of growth condition // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2018. – Vol. 102, № 19. – Р. 8419–8428. doi: 10.1007/s00253-018-9249-1.
    38. Kuzhyk Y., Mutenko H.,  Fedorenko V., Ostash B. Analysis of Streptomyces ghanaensisATCC14672 gene SSFG_07725 for putative γ-butyrolactone synthase// Folia Microbiol. – 2018. – Vol. 63, Is. 6. – P. 701–706. doi: 10.1007/s12223-018-0614-3.
    39. Ostash I., Kolvenbach B., Corvini P.F., Fedorenko V., Ostash B., Cichocka D. Gene cloning system for sulfonamide-mineralizing Microbacteriumstrain BR1 // J. Appl. Genet. – 2018. – Vol. 59, № 1. – P. 119–121. doi: 10.1007/s13353-017-0427-0
    40. Ostash B.O., Yushchuk O.S., Koshla O.T., Rebets Y., Ostash I.S., Sehin Y.V., Busche T., Kalinowski J., Muth G., Fedorenko V.O. Elucidation of the genetic mechanisms contributing to moenomycin resistance in actinobacteria // Фактори експериментальної еволюції організмів: зб. наук. пр. – К.: Укр. т-во генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова, 2018. – Т. 22. – С. 203–209. DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v22.949
    41. Gren T., Ostash B., Babiy V., Rokytskyy I., Fedorenko V. Analysis of Streptomyces coelicolorM145 genes SCO4164 and SCO5854 encoding putative rhodaneses // Folia Microbiol. – 2018.– Vol. 63, № 2. – P. 197–201. doi: 10.1007/s12223-017-0551-6
    42. Koshla O. Lopatniuk M., Rokytskyy I., Yushchuk O., Dacyuk Y., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Ostash B. Properties of Streptomyces albusJ1074 mutant deficient in tRNALeuUAA gene bldA// Arch. Microbiol. – 2017. – Vol. 199, Is. 8. – P. 1175–1183. doi: 10.1007/s00203-017-1389-7
    43. Vasylechko V.O., Fedorenko V.O., Gromyko O.M., Gryshchouk G.V., Kalychak Y.M., Zaporozhets O.A., Lototska M.T. Solid phase extractive preconcentration of silver from aqueous samples and antimicrobial properties of the clinoptilolite–Ag composite // Adsorption Sci. & Technol. – 2017. – Vol. 35, Is.7–8. – P. 602–611. doi: 10.1177/0263617417703509
    44. Tsypik O., Makitrynskyy R., Bera A., Song L., Wohlleben W., Fedorenko V., Ostash B. Role of GntR family regulatory gene SCO1678 in gluconate metabolism in Streptomyces coelicolor M145 // Biomed. Res. Int. – 2017. –9529501. doi: 10.1155/2017/9529501
    45. Rokytskyy I., Koshla O., Fedorenko V., Ostash B. Decoding options and accuracy of translation of developmentally regulated UUA codon in Streptomyces: bioinformatic analysis // Springerplus – 2016. – 5(1):982. doi: 10.1186/s40064-016-2683-6
    46. Horbal L., Ostash B., Luzhetskyy A., Walker S., Kalinowski J., Fedorenko V. A gene cluster for the biosynthesis of moenomycin family antibiotics in the genome of teicoplanin producer Actinoplanes teichomyceticus// Appl. Microbil. Biotechnol. – 2016. – Vol. 100, Is. 17. – P.7629–7638. doi: 10.1007/s00253-016-7685-3
    47. Klymyshin D., Stephanyshyn O., Fedorenko V. Participation of (p)ppGpp molecules in the formation of “stringent response” in bacteria, as well as in the biosynthesis of antibiotics and morphological differentiation in actinomycetes // Cytology and Genetics – 2016. – Vol. 50, Is. 2. – P.134–142. https://doi.org/10.3103/S0095452716020067
    48. Shashkov A.S., Streshinskaya G.M., Tul’skaya E.M., Senchenkova S.N., Baryshnikova L.M., Dmitrenok A.S., Ostash B.E., Fedorenko V.A. Cell wall glycopolymers of Streptomyces albus, Streptomyces albidoflavusand Streptomyces pathocidini// Antonie Van Leeuwenhoek – 2016. – Vol. 109, Is. 7. – P.923–936. doi: 10.1007/s10482-016-0691-8
    49. Tsypik O., Yushchuk O., Zaburannyi N., Flärdh K., Walker S., Fedorenko V., Ostash B. Transcriptional regulators of GntR family in Streptomyces coelicolorA3(2): analysis in silico and in vivo of YtrA subfamily // Folia Microbiol. – 2016. – Vol. 61, Is. 3. – P.209–220. doi: 10.1007/s12223-015-0426-7
    50. Yushchuk O., Ostash B., Pham T.H., Luzhetskyy A., Fedorenko V.,. Truman A.W, Horbal L. Characterization of the post-assembly line tailoring processes in teicoplanin biosynthesis // ACS Chem. Biol. – 2016. – Vol. 11, Is. 8. – P.2254–2264. doi: 10.1021/acschembio.6b00018
    51. Yushchuk O., Horbal L., Datsyuk Ju., Stegmann E., Fedorenko Peculiarities of Actiniplanes teichomyceticus NRRL-B16726 morphology and life cycle // Visnyk of the Lviv University. Biol. Ser. – 2016. – Vol. 71. – P. 126–136.
    52. Zhurayev R., Proost D., Zerbino D., Fedorenko V., Meester J.A., van Laer L., Loeys B.L. Identification of FBN1gene mutations in Ukrainian Marfan syndrome patients // Genet. Res. – 2016. – 98:e13. doi:10.1017/S0016672316000112
    53. Fedorenko V., Genilloud O., Horbal L., Marcone G.L., Marinelli F., Paitan Y., Ron E.Z. Antibacterial discovery and development: from gene to product and back // BioMed Res. Int. – 2015. – 2015:591349. doi: 10.1155/2015/591349.
    54. Ostash B., Yushchuk O., Tistechok S., Mutenko H., Horbal L., Muryn A., Dacyuk Y., Kalinowski J., Luzhetskyy A., Fedorenko V. The adpA-like regulatory gene from Actinoplanes teichomyceticus: in silico analysis and heterologous expression // World J. Microbiol. Biotechnol. – 2015. Vol. 31, Is. 8, – P. 1297–1301. doi: 10.1007/s11274-015-1882-6
    55. Lopatniuk M., Ostash B., Makitrynskyy R., Walker S., Luzhetskyy A., Fedorenko V. Testing the utility of site-specific recombinases for manipulations of genome of moenomycin producer Streptomyces ghanaensisATCC14672 // J. Appl. Genet. – 2015. – Vol. 56, Is. 4 – P. 547–550. doi: 10.1007/s13353-015-0283-8
    56. Klymyshin D.A., Stefanyshyn O.N., Fedorenko V.A. Role of genes snoaM, snoaL, and snoaEin the biosynthesis of nogalamycin in Streptomyces nogalater //Cytology and Genetics – 2015. – Vol.49, Is.3. – P. 152–157. doi:10.3103/S0095452715030081
    57. Raju R., O. Gromyko, V. Fedorenko, A. Luzketskyy, R. Muller. Albaflavenol B, a new sesquiterpene isolated from the terrestrial actinomycete, Streptomyces// J. Antibiot. –. 2015. – Vol.68, Is.4. – P. 286–288. doi: 10.1038/ja.2014.138.
    58. Horbal L., Kobylyanskyy A., Truman A.W., Zaburranyi N., Ostash B., Luzhetskyy A., Marinelli F., Fedorenko V. The pathway-specific regulatory genes, tei15* and tei16*, are the master switches of teicoplanin production in Actinoplanes teichomyceticus // Microbiol. Biotechnol. – 2014, Vol. 98, Is. 22. – P. 9295–9309. doi:10.1007/s00253-014-5969-z
    59. Horbal L., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Novel and tightly regulated resorcinol and cumate-inducible expression systems for Streptomyces and other actinobacteria // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2014, Vol. 98, Is. 20. – P.8641–8655. doi:10.1007/s00253-014-5918-x
    60. Mutenko H., R. Makitrinskyy, O. Tsypik, S. Walker, B. Ostash, V. Fedorenko. Genes for biosynthesis of butenolide like signalling molecules in Streptomyces ghanaensis, their role in moenomycin production //  Rus. J. Genetics – 2014. – Vol. 50, No. 6. – Р. 563–568. DOI:10.1134/S1022795414060076
    61. Rabyk M.V., Ostash B.O., Fedorenko V.O. Gene networks that regulate secondary metabolism in actinomycetes: pleiotropic regulators // Cytology and Genetics – 2014 – Vol. 48, N.1. – Vol. 55–67. doi:10.3103/S0095452714010083
    62. Ostash B., Shashkov A., Streshinskaya G., Tul’skaya E., Baryshnikova L., Dmitrenok A., Dacyuk Y., Fedorenko V. Identification of Streptomyces coelicolorM145 genomic region involved in biosynthesis of teichulosonic acid-cell wall glycopolymer // Folia Microbiol. – 2014 – Vol.59, N4 – P. 355–360. doi: 10.1007/s12223-014-0306-6
    63. Zaburannyi N., Rabyk M., Ostash B., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Insights into naturally minimised Streptomyces albusJ1074 genome // BMC Genomics. – 2014 – 5;15:97. doi: 10.1186/1471-2164-15-97
    64. Raju R., Gromyko O., Butsiak A., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Oleamycins A and B: new antibacterial cyclic hexadepsipeptides isolated from a terrestrial Streptomyces // J.  – 2014. – Vol. 67, N.4. – P. 339–343. doi: 10.1038/ja.2014.1
    65. Gren T., Ostash B., Hrubskyy Y., Tistechok S., Fedorenko V. Influence of transition metals on Streptomyces coelicolorand sioyaensis and generation of chromate-reducing mutants // Folia Microbiol. – 2014. – Vol.59, N2. – P. 147–153. doi: 10.1007/s12223-013-0277-z
    66. Ostash B., Gren T., Hrubskyy Y., Tistechok S., Beshley S., Baranov V., Fedorenko V. Cultivable actinomycetes from rhizosphere of birch (Betula pendula) growing on a coal mine dump in Silets, Ukraine // J. Basic Microbiol. – 2014. – Vol. 54, N.8. – P. 851–857. doi: 10.1002/jobm.201200551
    67. Klymyshin D.O., Nimets O.Ya., Stefanyshyn O.M., Fedorenko V.O. Heterologeus expression of lndYRand wblAgh genes in producers of anthracyclin antibiotics Streptomyces nogalaterLv65,  echinatus DSM40730 and  peucetius subsp. caesius ATCC27952 // Cytology and Genetics. – 2013. – Vol. 47, Issue 4. – P. 197–201. https://doi.org/10.3103/S0095452713040063
    68. Makitrynskyy R., Ostash B., Tsypik O., Rebets Y., Doud E., Meredith T., Luzhetskyy A., Bechthold A., Walker S., Fedorenko V. Pliotropic regulatory genes bldAadpAand absB are implicated in production of phosphoglycolipid antibiotic moenomycin // Open Biol. – 2013. – 3(10):130121. doi:10.1098/rsob.130121
    69. Horbal L., Kobylyanskyy A., Yushchuk O., Zaburannyi N., Luzhetskyy A., Ostash B., Marinelli F., Fedorenko V. Evaluation of heterologous promoters for genetic analysis of Actinoplanes teichomyceticus– producer of teicoplanin, drug of last defense // J. Biotechnol. – 2013 –Vol.168, N 4. – P. 367–372. doi: 10.1016/j.jbiotec.2013.10.018.
    70. Ostash B., Ostash I., Horbal L., Fedorenko V. Exploring and exploiting gene networks that regulate natural products biosynthesis in Actinobacteria// Natural Prod. J. – 2013. – Vol.3, N.3. – P.189–198. doi: 10.2174/22103155113039990013
    71. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Oleaceran: A novel spiro[isobenzofuran-1,2′-naptho[1,8-bc]furan] isolated from a terrestrial Streptomyces // Organic Lett. – 2013. – 15, Is. 14 – P. 3487-3489. doi: 10.1021/ol401490u
    72. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Lorneic acids C and D, new trialkyl-substituted aromatic acids isolated from a terrestrial Streptomyces // J.  – 2013. – Vol. 66, N 6. – P. 7–9. doi: 10.1038/ja.2013.18
    73. Horbal L., Fedorenko V., Bechthold A., Luzhetskyy A. A transposon-based strategy to identify the regulatory gene network responsible for landomycin E biosynthesis // FEMS Microbiol. Lett. – 2013. – Vol. 342, N 2. – P. 138–146. doi: 10.1111/1574-6968.12117
    74. Klimishin D.A., Rabyk M.V., Fedorenko V.A. Methylation of nogalose during nogalomycin biosynthesis by Streptomyces nogalater // Mikrobiologу – 2013. – Vol. 82, No – P. 162–168. https://doi.org/10.1134/S0026261713010049
    75. Tsypic O., Ostash B., Rebets Yu., Fedorenko V. Characterization of the Streptomyces globisporus1912 lnd-cluster region containing the lndY, lndYR,lndW2, and lndWgenes //. Cytology and Genetics – 2013. – Vol. 47, No. 1. – P. 8–12. https://doi.org/10.3103/S0095452713010106
    76. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Herrmann J., Luzhetskyy A., Muller R. Rubimycinone A, a new anthraquinone from a terrestrial Streptomyces //Tetrahedron Lett. – 2013. – Vol. 54, Is. 8. – P. 900–902. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2012.11.130
    77. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Plaza A., Muller R. Juniperolide A: a new polyketide isolated from a terrestrial actinomycete, Streptomyces // Organic Lett. – 2012. – Vol. 14, No. 23. – P. 5860–5863. doi: 10.1021/ol302766z
    78. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Leоpolic acid A, isolated from terrestrial actinomycete, Streptomyces // Tetrahedron Lett. – 2012. – Vol. 53, Is. 46. – P. 6300–6301. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2012.09.046
    79. Shashkov A.S., Ostash B.E., Fedorenko V.A., Streshinskaya G.M., Tul’skaya E.M., Senchenkova S.N., Baryshnikova L.M., Evtushenko L.I. Novel teichulosonic acid from cell wall of Streptomyces coelicolor// Carbohydr. Res. – 2012. – Vol. 359. – P. 70–75. doi: 10.1016/j.carres.2012.05.018
    80. Horbal L., RebetsY., Rabyk M., Makitrynskyy R., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Bechthold A. SimReg1 is a master swich for biosynthesis and export of simocyclinone D8 and its precursors // AMB Express – 2012, 2:1. doi: 10.1186/2191-0855-2-1
    81. Horbal L., Zaburannyy N., Ostash B., Shulga S., Fedorenko V. Manipulating the regulatory genes for teicoplanin production in Actinoplanes teichomyceticus //World J. Microbiol. Biotechnol. – 2012. – Vol. 28. – P. 2095–2100. doi: 10.1007/s11274-012-1013-6
    82. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Pimprinols A-C, from terrestrial actinomycete, Streptomyces// Tetrahedron Lett. – 2012. – Vol. 53, Is. 24. – 3009–3011. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2012.03.134
    83. Ostash B., Rebets Y., Myronovskyy M., Tsypik O., Ostash I., Kulachkovskyy O., Datsyuk Y., Nakamura T., Walker S., Fedorenko V. Identification and characterization of the Streptomyces globisporus1912 regulatory gene lndYR that affects sporulation and antibiotic production // Microbiology – 2011. – Vol. 157. – P. 1240–1249. doi: 10.1099/mic.0.045088-0
    84. Myronovskyi M., Welle E., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Beta-glucuronidase as a sensitive and versatile reporter in actinomycetes // Environ. Microbiol. – 2011. – Vol. 77, Is.15. – P. 5420–5427. doi: 10.1128/AEM.00434-11
    85. Rabyk M. B. Ostash, Y. Rebets, S. Walker, V. Fedorenko. Streptomyces ghanaensispleiotropic regulatory gene wblAgh influences morphogenesis and moenomycin production // FEMS Microbiol. Lett. – 2011. – 33, Is.12. –  Р. 2481–2486. doi: 10.1007/s10529-011-0728z
    86. Klimishin D.A. Rabyk M.V., Gren’ T.P., Nimets’ O.Ya., Gonchar M.A., Gromyko A.N., Fedorenko V.A. Construction of Streptomyces nogalaterLv65 strains with enhanced nogalamicin biosynthesis using regulatory gene //  Appl. Biochem. Microbiol. – 2011. – Vol. 47, No. 6. – Р. 594–598. https://doi.org/10.1134/S0003683811060068
    87. Klymyshin D.O., Gren T.P., Fedorenko V.O. Role of the snorAgene in nogalamycin biosynthesis by strain Streptomyces nogalater //Mikrobiology – 2011. – 80, No. 4. – P. 496–501.  https://doi.org/10.1134/S0026261711040096
    88. Ostash B., Doud E., Fedorenko V. The molecular biology of moenomycins: towards novel antibiotics based on inhibition of bacterial peptidoglycan glycosyltransferases // Biol. Chem. 2010. – Vol. 391, No 5. – P. 499–504. doi: 10.1515/BC.2010.053
    89. Ostash B., Ostash I., Zhu L., Kharel M.K., Luzhetskyy A., Behthold A., Walker S., Rohr J., Fedorenko V. Properties of lanK-based regulatory circuit involved in landomycin biosynthesis in Streptomyces cyanogenus// Rus. J. Genet. – Vol. 46, No. 5. – P. 530–535. https://doi.org/10.1134/S1022795410050030
    90. Makitrynskyy R., Rebets Y., Ostash B., Zaburannyi N., Rabyk M., Walker S., Fedorenko V. Genetic factors that influence moenomycin production in streptomycetes // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – Vol. 37, No. 6. – P. 599–566. doi: 10.1007/s10295-010-0701-1
    91. Horbal L., Rebets Y., Rabyk M., Luzhetskyy A., Welle E., Ostash B., Nakamura T., Fedorenko V., Bechthold A. Characterization and analysis of the regulatory network involved in control of lipomycin biosynthesis in Streptomyces aureofaciensTu117 // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – Vol. 85, N 4. – P. 1069–1079. https://doi.org/10.1007/s00253-009-2108-3
    92. Kobylyanskyy A., Ostash B., Fedorenko V. Heterologous cross-expression of oxygenase and glycosyltransferase genes in streptomycetes, producing angucyclic antibiotics // Cytol. Genet. – 2009. – 43, No. 3. – P. 194–200. https://doi.org/10.3103/S0095452709030098
    93. Ostash B., Korynevska A., Stoika R., Fedorenko V. Chemistry and biology of landomycins, an expanding family of polyketide natural products // Mini Rev. Med. Chem. – 2009. – Vol. 9, Is. 9 – P. 1040–1051. doi: 10.2174/138955709788922593
    94. Rebets Y., Boll R., Horbal L., Fedorenko V., Bechthold A. Production of avilamycin A is regulated by AviC1 and AviC2, two transcriptional activators // J. Antibiot. – 2009. –Vol. 62, Is. 8. –P. 461–464. doi: 10.1038/ja.2009.63
    95. Zaburannyy N., Ostash B., Fedorenko V. TTA Lynx: a web-based service for analysis of actinomycete genes containing rare TTA codon // Bioinformatics – 2009. – Vol. 25, Is. 18. –P. 2432–243 doi: 10.1093/bioinformatics/btp402
    96. Myronovskyy M., Ostash B., Ostash I., Fedorenko V. A gene cloning system for the siomycin producer Streptomyces sioyaensisNRRL-B5408 // Folia Microbiol. – 2009. – Vol. 54, Is. 2. –P. 91–9  doi: 10.1007/s12223-009-0013-x
    97. Ostash B., Makitrinskyy R., Walker S., Fedorenko V. Identification and characterization of Streptomyces ghanaensis ATCC14672 integration sites for three actinophage-based plasmids // Plasmid – 2009. – Vol. 61, Is. 3. – P. 171–17 doi: 0.1016/j.plasmid.2008.12.002
    98. Ostash I., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Walker S., Fedorenko V. Coordination of export and glycosylation of landomycins in Streptomyces cyanogenus// FEMS Microbiol. Lett. – 2008. – Vol. 285, Is. 2 – P. 195–202.  doi: 10.1111/j.1574-6968.2008.01225.x
    99. Ostash I., Rebets Y., Ostash B., Kobylyanskyy A., Myronovskyy M., Nakamura T., Walker S., Fedorenko V. An ABC transporter encoding gene lndW confers resistance to landomycin E // Arch. Microbiol. – 2008. – Vol. 190, Is. 1. – P. 105-9. doi: 10.1007/s00203-008-0367-5
    100. Klymyshin D.O., Hromyko O.M., Fedorenko V.O. Application of intergeneric conjugation of Escherichia coli — Streptomycesfor transfer of recombinant DNA into the strain S. nogalater IMET43360 // Cytology and Genetics – 2007. – Vol. 41, No. 5. – P. 263–267.  https://doi.org/10.3103/S0095452707050015
    101. Rebets Y., Dutko L., Ostash B., Luzhetskyy A., Kulachkovskyy O., Yamaguchi T., Nakamura T., Bechthold A., Fedorenko V. Function of lanI in regulation of landomycin A biosynthesis in Streptomyces cyanogenusS136 and cross-complementation studies with Streptomycesantibiotic regulatory proteins encoding genes // Arch. Microbiol. – 2008. – Vol. 189, Is. 2. –P. 111–120. https://doi.org/10.1007/s00203-007-0299-5
    102. Baig I., Kharel M., Kobylyanskyy A., Zhu L., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Fedorenko V.A., Rohr J. On the acceptor substrate of C-glycosyltransferase UrdGT2: three prejadomycin C-Glycosides from an engineered mutant of Streptomyces globisporus1912 DeltalndE(urdGT2) // Angew. Chem. Int. Ed. – 2006. – Vol. 45, Is. 46. – P. 7842–7846.  http://dx.doi.org/10.1002/anie.200603176
    103. Rebets Y.V., Ostash B.O., Fukuhara M., Nakamura T., Fedorenko V.O. Expression of the regulatory protein LndI for landomycin E production in Streptomyces globisporus1912 is controlled by the availability of tRNA for the rare UUA codon // FEMS Microbiol. Lett. –2006. – Vol. 256, Is. 1. – P. 30–37. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2005.00087.x
    104. Dutko L., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Nakamura T., Fedorenko V. A putative proteinase gene is involved in regulation of landomycin E biosynthesis in Streptomyces globisporus// FEMS Microbiol. Lett. – 2006. – Vol. 255, Is.2. – 280–285.  https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2005.00085.x
    105. Ostash B.E., Ogonian S.V., Luzhetskiĭ A.N., Bechthold A., Fedorenko V.A. The use of PCR for detecting genes that encode type I polyketide synthases in genomes of actinomycetes // Rus. J. Genet. – 2005. – Vol. 41, No. 5. – P. 473–478. https://doi.org/10.1007/s11177-005-0113-x
    106. Ostash B., Kozarevska I., Fedorenko V. Generation of landomycin D-producing strain Streptomyces globisporus// Folia Microbiol. – 2005. – Vol. 50, Is. 1. – P. 19–23.  https://doi.org/10.1007/BF02931289
    107. Luzhetskyy A., Zhu L., Gibson M., Fedoryshyn M., Dürr C., Hofmann C., Hoffmeister D., Ostash B., Mattingly C., Adams V., Fedorenko V., Rohr J., Bechthold A. Generation of novel landomycins M and O through targeted gene disruption // Chembiochem – 2005. – Vol. 6, Is.4. – P. 675–67https://doi.org/10.1002/cbic.200400316
    108. Zhu L., Ostash B., Rix U., Nur-E-Alam M, Mayers A., Luzhetskyy A., Mendez C., Salas J.A., Bechthold A, Fedorenko V., Rohr J. Identification of the function of gene lndM2 encoding a bifunctional oxygenase-reductase involved in the biosynthesis of the antitumor antibiotic landomycin E by Streptomyces globisporus1912 supports the originally assigned structure for landomycinone // J. Org. Chrem. – 2005. – Vol. 70, Is. 2. – P. 631–638. doi: 10.1021/jo0483623
    109. Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Kushnir S., Fukuhara M., Bechthold A., Nashimoto M., Nakamura T., Fedorenko V. DNA-binding activity of LndI protein and temporal expression of the gene that upregulates landomycin E production in Streptomyces globisporus // Microbiology – 2005. – Vol. 51, Pt. 1. – P. 281-2 doi: 10.1099/mic.0.27244-0
    110. Luzhetskyy A., Liu T., Fedoryshyn M., Ostash B., Fedorenko V., Rohr J., Bechthold A. Function of lanGT3, a glycosyltransferase gene involved in landomycin A biosynthesis // Chembiochem – 2004. – 5, Is. 11. – P. 1567–1570. https://doi.org/10.1002/cbic.200400123
    111. Gromyko O., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Fukuhara M., Bechthold A., Nakamura T., Fedorenko V. Generation of Streptomyces globisporusSMY622 strain with increased landomycin E production and it’s initial characterization // J. Antibiot. – 2004. – Vol.57, Is. 6. –  P. 383–389.  https://doi.org/10.7164/antibiotics.57.383
    112. Ostash B., Rix U., Rix L.L., Liu T., Lombo F., Luzhetskyy A., Gromyko O., Wang C., Braña A.F., Méndez C., Salas J.A., Fedorenko V., Rohr J. Generation of new landomycins by combinatorial biosynthetic manipulation of the LndGT4 gene of the landomycin E cluster in Sglobisporus // Biol.(Cell Chemical Biology) – 2004. – Vol. 11, Is. 4. – P. 547–555. doi: https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2004.03.011
    113. Ostash B., Rebets Y., Yuskevich V., Luzhetskyy A., Tkachenko V., Fedorenko V. Targeted disruption of Streptomyces globisporuslndFand lndL cyclase genes involved in landomycin E biosynthesis // Folia Microbiol. – 2003. – Vol. 48, Is. 4. – P. 484–488.  https://doi.org/10.1007/BF02931329
    114. Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Hoffmeister D., Brana A., Mendez C., Salas J.A., Bechthold A., Fedorenko V. Production of landomycins in Streptomyces globisporus1912 and S cyanogenusS136 is regulated by genes encoding putative transcriptional activators // FEMS Microbiol Lett. – 2003. – Vol.222, Is. 1. – P. 149–1 https://doi.org/10.1016/S0378-1097(03)00258-1

Біографія

Народився 22 вересня 1951 року. У 1973 році закінчив з відзнакою біологічний факультет Львівського університету імені Івана Франка, а у 1979 році – аспірантуру у Всесоюзному науково-дослідному інституті генетики та селекції промислових мікроорганізмів, Москва.

У 1981 році захистив у цьому інституті кандидатську дисертацію.

У 2005 захистив докторську дисертацію в Інституті клітинної біології та генетичної інженерії НАН України, Київ)

З 1979 року працює на кафедрі генетики та біотехнології ЛНУ імені Івана Франка.

У 1979 – 1983 р. асистент, 1984 – 1993 р. – доцент, з 1994 р. – завідувач кафедри генетики та біотехнології.

Вчене звання доцента отримав у 1985 році, а професора – у 2006 році.

У 1988 році під його керівництвом створено НДЛ генетики, селекції та генетичної інженерії продуцентів біологічно активних речовин, а у 1995 році – Колекцію культур мікроорганізмів-продуцентів антибіотиків, яку у 2003 році включено до Державного реєстру наукових об’єктів, що становлять національне надбання України.

Стажувався в Московському університеті, Державному науковому центрі антибіотиків, Москва і Лейбніц-Інституті дослідження природних сполук та інфекційної біології, Єна, ФРН.

Член Ради і Президії Українського товариства генетиків і селекціонерів імені М.І. Вавилова і голова Львівського обласного відділення цього товариства.

Головний редактор журналу «Вісник Львівського університету. Серія біологічна».

Член редколегій журналів «Cytology and Genetics» і «Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів імені М. Вавилова».

Член секції за фаховим напрямом «Біологія, біотехнологія та актуальні проблеми медичних наук» Наукової ради Міністерства освіти і науки України.

Член секції Науково-технічної ради Міністерства освіти і науки України з питань формування та виконання державного замовлення на науково-технічну продукцію за пріоритетним напрямом науки і техніки «Науки про життя, нові технології профілактики та лікування найпоширеніших захворювань».

Член спеціалізованої ради із захисту дисертацій Д 35.246.01 в Інституті біології клітини НАН України, Львів.

Проекти

Науковий керівник держбюджетних тем:

Тема 97/0263 “Біотехнологічний та фармакологічний потенціал нового антимікобактерійного антибіотика Je478” Ґрант Національного фонду досліджень України. Термін виконання:01.05.2023-15.11.2025

Бг-203н „Колекція культур мікроорганізмів – продуцентів антибіотиків Львівського національного університету імені Івана Франка”. Номер державної реєстрації 0103U008453. Термін виконання: 01.01.2022 – 31.12.2022.

Нагороди

  • Державна премія України у галузі науки і техніки за 2018 рік за роботу “Біологічно активні речовини мікробного синтезу в новітніх біотехнологіях і сучасному аграрному виробництві”. Указ Президента України 110/2019 від 8 квітня 2019 року.
  • Заслужений професор Львівського університету, 2016.
  • Почесна грамота Кабінету Міністрів України, 2017.
  • Відмінник освіти України, 2011.
  • Почесна грамота Міністерства освіти і науки України, 2002.
  • Грамота Міністерства освіти і науки України, 2010.
  • Грамота департаменту освіти і науки Львівської обласної державної адміністрації, 2013.
  • Подяки ректора ЛНУ імені Івана Франка, 2001, 2008, 2011.
  • Подяки від департаменту освіти і науки Львівської обласної держадміністрації, Національного центру «Мала академія наук України», дирекції Всеукраїнського науково-технічного конкурсу «ІNTEL EKO Україна 2016» за підготовку переможців конкурсів науково-дослідницьких робіт школярів.

Методичні матеріали

  1. Федоренко В.О., Осташ Б.О., Гончар М.В., Ребець Ю.В. Великий практикум з генетики, генетичної інженерії та аналітичної біотехнології мікроорганізмів. Навч. посібник– Львів: Видавн. центр ЛНУ імені Івана Франка, 2007. – 279 с.
  2. Федоренко В.О., Черник Я.І., Максимів Д.В., Боднар Л.С. Задачі та вправи з генетики: Навч. Посібник.  – Львів : Оріяна-Нова, 2008. – 598 с.

Розклад

Сторінка розкладу викладачів не знайдена!