Серед моїх наукових інтересів:

• Генетика біосинтезу глікопептидних антибіотиків, розповсюдження і функціонування генів стійкості до них, пошук і комбінаторний біосинтез нових глікопептидних антибіотиків;
• Таксономія і особливості біології “нетипових” родів актиноміцетів (Actinoplanes, Nonomuraea, Amycolatopsis, Umezawaea) і створення генно-інженерних інструментів для них;
• Глобальні регуляторні механізми морфогенезу і продукції антибіотиків в актиноміцетів;
• Раціональна інженерія актиноміцетів-біотехнологічних продуцентів промислово-важливих сполук.

Із публікаціями можна ознайомитись за посиланням:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=yushchuk+o

Основні публікації за останні 5-ть років:

Rodler JP, Yushchuk O, Gavriilidou A, Siegert AK, Kulik A, Wohlleben W, Ziemert N, Stegmann E. Exploring shikimate pathway enzyme diversity for engineering of glycopeptide antibiotic biosynthesis. Metab Eng. 2026 Apr 3;96:277-289. doi: 10.1016/j.ymben.2026.03.019. Epub ahead of print. PMID: 41936863.

Yushchuk O, Rückert-Reed C, Busche T, Marinelli F, Kalinowski J. Updated sequence of ramoplanin biosynthetic gene cluster from Actinoplanes ramoplaninifer ATCC 33,076. J Appl Genet. 2026 May;67(2):503-510. doi: 10.1007/s13353-025-01035-6. Epub 2026 Jan 7. PMID: 41499035.

Yushchuk, O. Secondary metabolites from Actinokineospora spp.: insights into a sparsely studied genus of actinomycetes. Fermentation. 2025, 11(12), 663. https://doi.org/10.3390/fermentation11120663.

Yushchuk O, Berini F, Zhong L, Rückert-Reed C, Bernasconi E, Bartolone L, Busche T, Kalinowski J, Süssmuth RD, Marinelli F. A rare peptide scaffold in kineomicins, the glycopeptide antibiotics produced by Actinokineospora auranticolor DSM 44650. Commun Chem. 2025 May 3;8(1):134. doi: 10.1038/s42004-025-01534-x. PMID: 40319198; PMCID: PMC12049478.

Stepanyshyn A, Rückert-Reed C, Busche T, Yaruta B, Andreo-Vidal A, Marinelli F, Kalinowski J, Yushchuk O. Complete Genome Assembly of Amycolatopsis bartoniae DSM 45807^T Allows the Characterization of a Novel Glycopeptide Biosynthetic Gene Cluster. Genes (Basel). 2024 Dec 22;15(12):1651. doi: 10.3390/genes15121651. PMID: 39766918; PMCID: PMC11727664.

Zhukrovska K, Binda E, Fedorenko V, Marinelli F, Yushchuk O. The Impact of Heterologous Regulatory Genes from Lipodepsipeptide Biosynthetic Gene Clusters on the Production of Teicoplanin and A40926. Antibiotics (Basel). 2024 Jan 24;13(2):115. doi: 10.3390/antibiotics13020115. PMID: 38391501; PMCID: PMC10886168.

Yushchuk O, Binda E, Rückert-Reed C, Berini F, Fedorenko V, Kalinowski J, Marinelli F. Actinoplanes oblitus sp. nov., producing the glycopeptide antibiotic A477. Int J Syst Evol Microbiol. 2024 Jan;74(1). doi: 10.1099/ijsem.0.006225. PMID: 38190227.

Andreo-Vidal A, Yushchuk O, Marinelli F, Binda E. Cross-Talking of Pathway-Specific Regulators in Glycopeptide Antibiotics (Teicoplanin and A40926) Production. Antibiotics (Basel). 2023 Mar 24;12(4):641. doi: 10.3390/antibiotics12040641. PMID: 37107003; PMCID: PMC10135024.

Ostash B, Makitrynskyy R, Yushchuk O, Fedorenko V. Structural diversity, bioactivity, and biosynthesis of phosphoglycolipid family antibiotics: Recent advances. BBA Adv. 2022 Nov 17;2:100065. doi: 10.1016/j.bbadva.2022.100065. PMID: 37082588; PMCID: PMC10074958.

Yushchuk O, Zhukrovska K, Ostash B, Fedorenko V, Marinelli F. Heterologous Expression Reveals Ancient Properties of Tei3—A VanS Ortholog from the Teicoplanin Producer Actinoplanes teichomyceticus. Int J Mol Sci. 2022 Dec 11;23(24):15713. doi: 10.3390/ijms232415713. PMID: 36555354; PMCID: PMC9779433.

Yushchuk O, Binda E, Fedorenko V, Marinelli F. Occurrence of vanHAX and Related Genes beyond the Actinobacteria Phylum. Genes (Basel). 2022 Oct 27;13(11):1960. doi: 10.3390/genes13111960. PMID: 36360197; PMCID: PMC9689679.

Yushchuk O, Zhukrovska K, Berini F, Fedorenko V, Marinelli F. Genetics Behind the Glycosylation Patterns in the Biosynthesis of Dalbaheptides. Front Chem. 2022 Mar 24;10:858708. doi: 10.3389/fchem.2022.858708. PMID: 35402387; PMCID: PMC8987122.

Melnyk S, Stepanyshyn A, Yushchuk O, Mandler M, Ostash I, Koshla O, Fedorenko V, Kahne D, Ostash B. Genetic approaches to improve clorobiocin production in Streptomyces roseochromogenes NRRL 3504. Appl Microbiol Biotechnol. 2022 Feb;106(4):1543-1556. doi: 10.1007/s00253-022-11814-4. Epub 2022 Feb 11. PMID: 35147743; PMCID: PMC9528727.

Andreo-Vidal A, Binda E, Fedorenko V, Marinelli F, Yushchuk O. Genomic Insights into the Distribution and Phylogeny of Glycopeptide Resistance Determinants within the Actinobacteria Phylum. Antibiotics (Basel). 2021 Dec 14;10(12):1533. doi: 10.3390/antibiotics10121533. PMID: 34943745; PMCID: PMC8698665.

Hrab P, Rückert C, Busche T, Ostash I, Kalinowski J, Fedorenko V, Yushchuk O, Ostash B. Complete genome sequence of Streptomyces cyanogenus S136, producer of anticancer angucycline landomycin A. 3 Biotech. 2021 Jun;11(6):282. doi: 10.1007/s13205-021-02834-4. Epub 2021 May 21. PMID: 34094801; PMCID: PMC8137763.

Yushchuk O, Vior NM, Andreo-Vidal A, Berini F, Rückert C, Busche T, Binda E, Kalinowski J, Truman AW, Marinelli F. Genomic-Led Discovery of a Novel Glycopeptide Antibiotic by Nonomuraea coxensis DSM 45129. ACS Chem Biol. 2021 May 21;16(5):915-928. doi: 10.1021/acschembio.1c00170. Epub 2021 Apr 29. PMID: 33913701; PMCID: PMC8291499.

Yushchuk O, Ostash I, Mösker E, Vlasiuk I, Deneka M, Rückert C, Busche T, Fedorenko V, Kalinowski J, Süssmuth RD, Ostash B. Eliciting the silent lucensomycin biosynthetic pathway in Streptomyces cyanogenus S136 via manipulation of the global regulatory gene adpA. Sci Rep. 2021 Feb 10;11(1):3507. doi: 10.1038/s41598-021-82934-6. PMID: 33568768; PMCID: PMC7875965.

Yushchuk O, Binda E, Marinelli F. Glycopeptide Antibiotic Resistance Genes: Distribution and Function in the Producer Actinomycetes. Front Microbiol. 2020 Jun 17;11:1173. doi: 10.3389/fmicb.2020.01173. PMID: 32655512; PMCID: PMC7325946.

Yushchuk O, Ostash B, Truman AW, Marinelli F, Fedorenko V. Teicoplanin biosynthesis: unraveling the interplay of structural, regulatory, and resistance genes. Appl Microbiol Biotechnol. 2020 Apr;104(8):3279-3291. doi: 10.1007/s00253-020-10436-y. Epub 2020 Feb 19. PMID: 32076781.

Yushchuk O, Andreo-Vidal A, Marcone GL, Bibb M, Marinelli F, Binda E. New Molecular Tools for Regulation and Improvement of A40926 Glycopeptide Antibiotic Production in Nonomuraea gerenzanensis ATCC 39727. Front Microbiol. 2020 Jan 21;11:8. doi: 10.3389/fmicb.2020.00008. PMID: 32038594; PMCID: PMC6985074.

Yushchuk O, Homoniuk V, Ostash B, Marinelli F, Fedorenko V. Genetic insights into the mechanism of teicoplanin self-resistance in Actinoplanes teichomyceticus. J Antibiot (Tokyo). 2020 Apr;73(4):255-259. doi: 10.1038/s41429-019-0274-9. Epub 2020 Jan 17. PMID: 31953525.

Yushchuk O, Homoniuk V, Datsiuk Y, Ostash B, Marinelli F, Fedorenko V. Development of a gene expression system for the uncommon actinomycete Actinoplanes rectilineatus NRRL B-16090. J Appl Genet. 2020 Feb;61(1):141-149. doi: 10.1007/s13353-019-00534-7. Epub 2020 Jan 7. PMID: 31912451.

Освіта:

2024 – отримав атестат старшого дослідника за спеціальністю 091 «Біологія та біохімія».

2023 – отримав диплом доктора біологічних наук за спеціальністю 03.00.22 молекулярна генетика. Тема дисертації: «Генетичні механізми регуляції біосинтезу пептидних та полікетидних антибіотиків».

2018 – отримав диплом кандидата біологічних наук за спеціальністю 03.00.22 молекулярна генетика. Тема дисертації: «Генетичний контроль біосинтезу тейкопланіну в Actinoplanes teichomyceticus».

2012-2017 – аспірант кафедри генетики та біотехнології Львівського національного університету імені Івана Франка.

2012 – отримав диплом магістра генетики (з відзнакою). Тема дипломної роботи: “Роль генів регуляторів підродини YtrA у вторинному метаболізмі стрептоміцетів”.

2011 – отримав диплом бакалавра біології (з відзнакою).

2007-2012 – студент біологічного факультету Львівського національного університету імені Івана Франка.

2007 – закінчив Львівську академічну гімназію із золотою медаллю.

Професійна кар’єра:

2024-дотепер – провідний науковий співробітника НДЧ Львівського національного університету імені Івана Франка, професор кафедри генетики та біотехнології (сумісник).

2020-2024 – старший науковий співробітник НДЧ Львівського національного університету імені Івана Франка.

2018-2020 – науковий співробітник в Universitа degli studi dell’Insubria (Varese, Italy). Виконував пов’язаний із виробництвом проект, який стосувався покращення продукцї антибіотиків в штамах Aspergillus.

2017-2018 – молодший науковий співробітник НДЧ Львівського національного університету імені Івана Франка.

2014-2015 – гостьовий аспірант в Interfaculty Institute of Microbiology and Infection Medicine, Eberhard Karls Universität Tübingen (Німеччина), в рамках персонального гранту від DAAD.

2014 – гостьовий аспірант кафедри Biotechnology and Life sciences, Universitа degli studi dell’Insubria (Варезе, Італія), в рамках персонального гранту від Consorzio Interuniversitario per le biotecnologie (Італія).

Науковий керівник держбюджетної теми БГ-14Е «Нові антибіотики пептидної природи, активні проти мультирезистентних патогенів: від генів до сполук» (Державний реєстраційний номер: 0125U000501).

2026 – Стипендіат Львівського Товариства Науковців (ініціатива Українського Католицького Університету за підтримки Фонду Сімонса).

2026 – Стипендія Кабінету Міністрів України для молодих вчених.

2026 – Переможець грантової програми “Talents for Ukraine” від KSE Foundation.

2025 – Персональна стипендія Верховної Ради України для молодих вчених-докторів наук.

2025 – Викладацька стипендія імені Ореста Вовка Українського Католицького Університету.

2024 – Грант Horizon 2020 Eurizon fellowship programme: “Remote Research Grants for Ukrainian Researchers” (керівник).

2024 – Подяка Міністерства освіти і науки України.

2023 – Премія Львівської обласної військової адміністрації для науковців.

2022 – Подяка Ректора Львівського національного університету ім. Івана Франка.

2022 – Премія Верховної Ради України найталановитішим молодим ученим в галузі фундаментальних і прикладних досліджень та науково-технічних розробок.

2022 – Грант фонду Александра фон Гумбольдта для постдокторальних науковців.

2022 – Старший дослідницький грант від Università degli studi dell’Insubria для постдокторальних науковців з-за меж Європейського Союзу.

2021 – Старший дослідницький грант від Università degli studi dell’Insubria для постдокторальних науковців з-за меж Європейського Союзу.

2014 – Персональний грант від Consorzio Interuniversitario per le biotecnologie (Італія).

2014 – Персональний грант від DAAD (Deutscher Akademischer Austauschdienst).

2012 – Стипендія Фонду Віктора Пінчука; перемога на Всеукраїнському конкурсі студентських наукових робіт.

Сторінка розкладу викладачів не знайдена!