Федоренко Віктор Олександрович

Посада: завідувач кафедри генетики та біотехнології

Науковий ступінь: доктор біологічних наук

Вчене звання: професор

Телефони (робочі): 239-47-68, 239-44-07, (032) 239-44-75

Електронна пошта: viktor.fedorenko@lnu.edu.ua

Профіль у Google Scholar: scholar.google.com.ua

Наукові інтереси

Наукові інтереси:

  • Генетика, селекція і генетична інженерія актинобактерій.
  • Генетичний контроль біосинтезу антибіотиків та стійкості до антибіотиків.
  • Механізми регулювання експресії геному бактерій.

Науковий керівник:

  • НДЛ-42 генетики, селекції та генетичної інженерії продуцентів біологічно активних речовин.
  • Колекції культур мікроорганізмів-продуцентів антибіотиків ЛНУ імені Івана Франка.

Дис… канд. біол. наук: “Генетична нестабільність ознак стійкості до антибіотиків у Strepomyces coelicolor A3(2)”, 1981 р., Всесоюзний науково-дослідний інститут генетики та селекції промислових мікроорганізмів (Москва). Спеціальність 03.00.15 – генетика. Науковий керівник: проф. Ломовська Н.Д.

Дис… д-ра біол. наук: “Генетичний контроль стійкості актиноміцетів до антибіотиків та його роль у біосинтезі антибіотиків”, 2005 р., Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України (Київ). Спеціальність 03.00.15 – генетика.

Науковий керівник і консультант кандидатських дисертацій: Настасяка І.М., Кириченко Н.В., Заворотної С.А., Голець Л.М., Демидчук Ю.О., Дубицької Л.П., Осташа Б.О., Лужецького А.М., Ребця Ю.В., Громика О.М., Осташ І.С., Климишина Д.О. , Горбаль Л.О., Кобилянського А.М., Мироновського М.Л., Макітринського Р.П., Ющука О.С., Грубського Я.П. та докторських дисертацій Осташа Б.О., Громика О.М., Климишина Д.О.

Курси

Публікації

  • Профіль в Scopus:

https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=7103033524

  • Профіль в Researchgate:

https://www.researchgate.net/profile/Victor_Fedorenko

  • Cписок публікацій в Pubmed:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Fedorenko+V

 

Монографії:

  1. Осташ Б., Ющук О., Осташ І., Рабик М., Федоренко В. Біологія антибіотиків – інгібіторів синтезу клітинної стінки бактерій– Львів : ЛНУ імені Івана Франка, 2018 – 235 с.
  2. Ostash B., Yan X., Fedorenko V., Bechthold A. Chemoenzymatic and bioenzymatic synthesis of carbohydrate containing natural products. In “Natural products via enzymatic reactions”. Top. Curr. Chem., Vol. 297: Ed. J. Piel. – Springer-Verlag Berlin Heidelberg : 2010. – P. 105–148.

 

Вибрані публікації у періодичних виданнях за 2001-2019 роки:

  1.  Vasylechko V., Fedorenko V., Gromyko O., Gryshchouk G., Kalychak  Y., Tistechok S., Us I., A novel solid-phase extraction method for preconcentration of silver and antimicrobial properties of the Na-clinoptilolite–Ag composite // Materials Today: Proceedings. Available online 6 November 2019. https://doi.org/10.1016/j.matpr.2019.10.049
  2. Lopatniuk M., Myronovskyi M., Nottebrock A., Busche T., Kalinowski J., Ostash B., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Effect of “ribosome engineering” on the transcription level and production of S. albus indigenous secondary metabolites // Appl Microbiol Biotechnol. – 2019. – Vol. 103, № 17. – P. 7097-7110. doi: 10.1007/s00253-019-10005-y.
  3. Yushchuk O., Horbal L., Ostash B., Marinelli F., Wohlleben W., Stegmann E., Fedorenko V. Regulation of teicoplanin biosynthesis: refining the roles of tei cluster-situated regulatory genes // Appl Microbiol Biotechnol. – 2019. – Vol. 103, № 10. – Р. 4089-4102. doi: 10.1007/s00253-019-09789-w.
  4. Kuzhyk Y., Lopatniuk M., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Ostash B. Genome engineering approaches to improve nosokomycin A production by Streptomyces ghanaensis3 // Indian J Microbiol. – 2019. – Vol. 59, № 1. – Р. 109-111. doi: 10.1007/s12088-018-0761-x.
  5. Sehin Y, Koshla O, Dacyuk Y, Zhao R, Ross R, Myronovskyi M, Limbach PA, Luzhetskyy A, Walker S, Fedorenko V, Ostash B. Gene ssfg_01967 (miaB) for tRNA modification influences morphogenesis and moenomycin biosynthesis in Streptomyces ghanaensis ATCC14672 // – 2019. – Vol. 165, Is. 2. – P. 233-245. doi: 10.1099/mic.0.000747.
  6. Koshla O.T., Rokytskyy I.V., Ostash I.S., Busche T., Kalinowski J., Mösker E., Süssmuth R.D., Fedorenko V.O., Ostash O. Secondary metabolome and transcriptome of Streptomyces albus J1074 in liquid medium SG2 // Cytology and Genetics – 2019. – Vol. 53, Is. 1. – P 1–7. https://doi.org/10.3103/S0095452719010080.
  7. Yushchuk O., Ostash I., Vlasiuk I., Gren T., Luzhetskyy A., Kalinowski J., Fedorenko V., Ostash B. Heterologous AdpA transcription factors enhance landomycin production in Streptomyces cyanogenus S136 under a broad range of growth condition // Appl Microbiol Biotechnol. – 2018. – Vol. 102, № 19. – Р. 8419-8428. doi: 10.1007/s00253-018-9249-1.
  8. Kuzhyk Y., Mutenko H.,  Fedorenko V., Ostash B. Analysis of Streptomyces ghanaensis ATCC14672 gene SSFG_07725 for putative γ-butyrolactone synthase // Folia Microbiol. – 2018. – Vol. 63, Is. 6. – P. 701–706. doi: 10.1007/s12223-018-0614-3.
  9. Ostash I., Kolvenbach B., Corvini P.F., Fedorenko V., Ostash B., Cichocka D. Gene cloning system for sulfonamide-mineralizing Microbacterium strain BR1 // J. Appl. Genet. – 2018. – Vol. 59, № 1. – P. 119–121. doi: 10.1007/s13353-017-0427-0
  10. Gren T., Ostash B., Babiy V., Rokytskyy I., Fedorenko V. Analysis of Streptomyces coelicolor M145 genes SCO4164 and SCO5854 encoding putative rhodaneses // Folia Microbiol. – 2018.– Vol. 63, № 2. – P. 197–201. doi: 10.1007/s12223-017-0551-6
  11. Koshla O. Lopatniuk M., Rokytskyy I., Yushchuk O., Dacyuk Y., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Ostash B. Properties of Streptomyces albus J1074 mutant deficient in tRNALeuUAA gene bldA.// Arch. Microbiol. – 2017. – Vol. 199, Is. 8. – P. 1175–1183. doi: 10.1007/s00203-017-1389-7
  12. Vasylechko V.O., Fedorenko V.O., Gromyko O.M., Gryshchouk G.V., Kalychak Y.M., Zaporozhets O.A., Lototska M.T. Solid phase extractive preconcentration of silver from aqueous samples and antimicrobial properties of the clinoptilolite–Ag composite // Adsorption Sci. & Technol. – 2017. – Vol. 35, Is.7–8. – P. 602–611. doi: 10.1177/0263617417703509
  13. . Tsypik O., Makitrynskyy R., Bera A., Song L., Wohlleben W., Fedorenko V., Ostash B.. Role of GntR family regulatory gene SCO1678 in gluconate metabolism in Streptomyces coelicolor M145 // Biomed. Res. Int. – 2017. –9529501. doi: 10.1155/2017/9529501
  14. Rokytskyy I., Koshla O., Fedorenko V., Ostash B. Decoding options and accuracy of translation of developmentally regulated UUA codon in Streptomyces: bioinformatic analysis // Springerplus. – 2016. – 5(1):982. doi: 10.1186/s40064-016-2683-6
  15. Horbal L., Ostash B., Luzhetskyy A., Walker S., Kalinowski J., Fedorenko V. A gene cluster for the biosynthesis of moenomycin family antibiotics in the genome of teicoplanin producer Actinoplanes teichomyceticus // Appl.Microbiol. Biotechnol. – 2016. – Vol. 100, Is. 17. – P.7629–7638. doi: 10.1007/s00253-016-7685-3
  16. Klymyshin D. Stephanyshyn O., Fedorenko V. Participation of (p)ppGpp molecules in the formation of “stringent response” in bacteria, as well as in the biosynthesis of antibiotics and morphological differentiation in actinomycetes // Cytology and Genetics – 2016. – Vol. 50, Is. 2. – P.134–142. https://doi.org/10.3103/S0095452716020067
  17. Shashkov A.S., Streshinskaya G.M., Tul’skaya E.M., Senchenkova S.N., Baryshnikova L.M., Dmitrenok A.S., Ostash B.E., Fedorenko V.A. Cell wall glycopolymers of Streptomyces albus, Streptomyces albidoflavus and Streptomyces pathocidini // Antonie Van Leeuwenhoek – 2016. – Vol. 109, Is. 7. – P.923–936. doi: 10.1007/s10482-016-0691-8
  18. Tsypik O., Yushchuk O., Zaburannyi N., Flärdh K., Walker S., Fedorenko V., Ostash B. Transcriptional regulators of GntR family in Streptomyces coelicolor A3(2): analysis in silico and in vivo of YtrA subfamily // Folia Microbiol. – 2016. – Vol. 61, Is. 3. – P.209–220. doi: 10.1007/s12223-015-0426-7
  19. Yushchuk O., Ostash B., Pham T.H., Luzhetskyy A., Fedorenko V.,. Truman A.W, Horbal L. Characterization of the post-assembly line tailoring processes in teicoplanin biosynthesis // ACS Chem. Biol. – 2016. – Vol. 11, Is. 8. – P.2254–2264. doi: 10.1021/acschembio.6b00018
  20. Zhurayev R., Proost D., Zerbino D., Fedorenko V., Meester J.A., van Laer L., Loeys B.L. Identification of FBN1 gene mutations in Ukrainian Marfan syndrome patients // Genet. Res. – 2016. – 98:e13. doi:10.1017/S0016672316000112
  21. Fedorenko V., Genilloud O., Horbal L., Marcone G.L., Marinelli F., Paitan Y., Ron E.Z. Antibacterial discovery and development: from gene to product and back // BioMed Res. Int. – 2015. – 2015:591349. doi: 10.1155/2015/591349.
  22. Ostash B., Yushchuk O., Tistechok S., Mutenko H., Horbal L., Muryn A., Dacyuk Y., Kalinowski J., Luzhetskyy A., Fedorenko V. The adpA-like regulatory gene from Actinoplanes teichomyceticus: in silico analysis and heterologous expression // World J. Microbiol. Biotechnol. – 2015. Vol. 31, Is. 8, – P. 1297–1301. doi: 10.1007/s11274-015-1882-6
  23. Lopatniuk M., Ostash B., Makitrynskyy R., Walker S., Luzhetskyy A., Fedorenko V. Testing the utility of site-specific recombinases for manipulations of genome of moenomycin producer Streptomyces ghanaensis ATCC14672 // J. Appl. Genet. – 2015. – Vol. 56, Is. 4 – P. 547–550. doi: 10.1007/s13353-015-0283-8
  24. Klymyshin D.A., Stefanyshyn O.N., Fedorenko V.A. Role of genes snoaM, snoaL, and snoaE in the biosynthesis of nogalamycin in Streptomyces nogalater Cytology and Genetics – 2015. – Vol.49, Is.3. – P. 152–157. doi:10.3103/S0095452715030081
  25. Raju R., O. Gromyko, V. Fedorenko, A. Luzketskyy, R. Muller. Albaflavenol B, a new sesquiterpene isolated from the terrestrial actinomycete, Streptomyces J. Antibiot. –. 2015, Vol.68(4):286-8. doi: 10.1038/ja.2014.138.
  26. Horbal L., Kobylyanskyy A., Truman A.W., Zaburranyi N., Ostash B., Luzhetskyy A., Marinelli F., Fedorenko V. The pathway-specific regulatory genes, tei15* and tei16*, are the master switches of teicoplanin production in Actinoplanes teichomyceticus. Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2014, Vol. 98, Is. 22. – P. 9295–9309. doi:10.1007/s00253-014-5969-z
  27. Horbal L., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Novel and tightly regulated resorcinol and cumate-inducible expression systems for Streptomyces and other actinobacteria. Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2014, Vol. 98, Is. 20. – P.8641–8655. doi:10.1007/s00253-014-5918-x
  28. Mutenko H., R. Makitrinskyy, O. Tsypik, S. Walker, B. Ostash, V. Fedorenko. Genes for biosynthesis of butenolide like signalling molecules in Streptomyces ghanaensis, their role in moenomycin production. Rus. J. Genetics – 2014. – Vol. 50, No. 6. – Р. 563–568. DOI:10.1134/S1022795414060076
  29. Lopatniuk M., B. Ostash, A. Luzhetskyy, S. Walker, V. Fedorenko. Generation and study of the strains of streptomycetes – heterologous hosts for the production of moenomycin. Rus. J. Genetics – 2014. –Vol. 50, No. 4. – Р. 360–365. DOI:10.1134/S1022795414040085
  30. Rabyk M.V., Ostash B.O., Fedorenko V.O. Gene networks that regulate secondary metabolism in actinomycetes: pleiotropic regulators // Cytology and Genetics – 2014 – Vol. 48, N.1. – Vol. 55–67. doi:10.3103/S0095452714010083
  31. . Ostash B., Shashkov A., Streshinskaya G., Tul’skaya E., Baryshnikova L., Dmitrenok A., Dacyuk Y., Fedorenko V. Identification of Streptomyces coelicolor M145 genomic region involved in biosynthesis of teichulosonic acid-cell wall glycopolymer. Folia Microbiol. – 2014 – Vol.59, N4 – P. 355–360. doi: 10.1007/s12223-014-0306-6
  32. Zaburannyi N., Rabyk M., Ostash B., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Insights into naturally minimised Streptomyces albus J1074 genome. BMC Genomics. – 2014 – 5;15:97. doi: 10.1186/1471-2164-15-97
  33. Raju R., Gromyko O., Butsiak A., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Oleamycins A and B: new antibacterial cyclic hexadepsipeptides isolated from a terrestrial Streptomyces J. Antibiot. – 2014. – Vol. 67, N.4. – P. 339–343. doi: 10.1038/ja.2014.1
  34. . Gren T., Ostash B., Hrubskyy Y., Tistechok S., Fedorenko V. Influence of transition metals on Streptomyces coelicolor and S. sioyaensis and generation of chromate-reducing mutants. Folia Microbiol. – 2014. – Vol.59, N2. – P. 147–153. doi: 10.1007/s12223-013-0277-z
  35. Ostash B., Gren T., Hrubskyy Y., Tistechok S., Beshley S., Baranov V., Fedorenko V. Cultivable actinomycetes from rhizosphere of birch (Betula pendula) growing on a coal mine dump in Silets, Ukraine. J. Basic Microbiol. – 2014. – Vol. 54, N.8. – P. 851 – 857. doi: 10.1002/jobm.201200551
  36. Klymyshin D.O., Nimets O.Ya., Stefanyshyn O.M., Fedorenko V.O. Heterologeus expression of lndYR and wblAgh genes in producers of anthracyclin antibiotics Streptomyces nogalater Lv65, echinatus DSM40730 and S. peucetius subsp. caesius ATCC27952. Cytology and Genetics. – 2013. – Vol. 47, Issue 4. – P. 197–201. https://doi.org/10.3103/S0095452713040063
  37. Makitrynskyy R., Ostash B., Tsypik O., Rebets Y., Doud E., Meredith T., Luzhetskyy A., Bechthold A., Walker S., Fedorenko V. Pliotropic regulatory genes bldA, adpA and absB are implicated in production of phosphoglycolipid antibiotic moenomycin. Open Biol. – 2013. – 3(10):130121. doi:10.1098/rsob.130121
  38. Horbal L., Kobylyanskyy A., Yushchuk O., Zaburannyi N., Luzhetskyy A., Ostash B., Marinelli F., Fedorenko V. Evaluation of heterologous promoters for genetic analysis of Actinoplanes teichomyceticus – producer of teicoplanin, drug of last defense. J. Biotechnol. – 2013 –Vol.168, N 4. – P. 367–372. doi: 10.1016/j.jbiotec.2013.10.018.
  39. Ostash B., Ostash I., Horbal L., Fedorenko V. Exploring and exploiting gene networks that regulate natural products biosynthesis in Actinobacteria. Nat. Prod. J. – 2013. – Vol.3, N.3. – P.189–198. doi: 10.2174/22103155113039990013
  40. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Oleaceran: A novel spiro[isobenzofuran-1,2′-naptho[1,8-bc]furan] isolated from a terrestrial Streptomyces Organic Lett. 2013; 15(14):3487-3489. doi: 10.1021/ol401490u
  41. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Lorneic acids C and D, new trialkyl-substituted aromatic acids isolated from a terrestrial Streptomyces J. Antibiot. – 2013. Jun; Vol. 66, N 6. – P. 7-9. doi: 10.1038/ja.2013.18
  42. Horbal L., Fedorenko V., Bechthold A., Luzhetskyy A. A transposon-based strategy to identify the regulatory gene network responsible for landomycin E biosynthesis. FEMS Microbiol. Lett. – 2013 May; – Vol. 342, N 2. – P.:138-146. doi: 10.1111/1574-6968.12117
  43. Klimishin D.A., Rabyk M.V., Fedorenko V.A. Methylation of nogalose during nogalomycin biosynthesis by Streptomyces nogalater Mikrobiologу. – 2013. – Vol. 82, N2. – P. 162–168. https://doi.org/10.1134/S0026261713010049
  44. Tsypic O., Ostash B., Rebets Yu., Fedorenko V. Characterization of the Streptomyces globisporus 1912 lnd-cluster region containing the lndY, lndYR,lndW2, and lndW genes. Cytology and Genetics. – 2013. – Vol. 47, No. 1. – P. 8–12. https://doi.org/10.3103/S0095452713010106
  45. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Herrmann J., Luzhetskyy A., Muller R. Rubimycinone A, a new anthraquinone from a terrestrial Streptomyces – Tetrahedron Lett. – 2013. – Vol. 54, Is. 8. – P. 900-902. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2012.11.130
  46. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Plaza A., Muller R. Juniperolide A: a new polyketide isolated from a terrestrial actinomycete, Streptomyces Organic Lett. – 2012. – Vol. 14, N. 23. – P. 5860–5863. doi: 10.1021/ol302766z
  47. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Leоpolic acid A, isolated from terrestrial actinomycete, Streptomyces Tetrahedron Lett. – 2012. – Vol. 53, Is. 46. – P. 6300–6301. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2012.09.046
  48. Shashkov A.S., Ostash B.E., Fedorenko V.A., Streshinskaya G.M., Tul’skaya E.M., Senchenkova S.N., Baryshnikova L.M., Evtushenko L.I. Novel teichulosonic acid from cell wall of Streptomyces coelicolor Carbohydr. Res. – 2012. – Vol. 359. P. 70-75. doi: 10.1016/j.carres.2012.05.018
  49. Horbal L., RebetsY., Rabyk M., Makitrynskyy R., Luzhetskyy A., Fedorenko V., Bechthold A. SimReg1 is a master swich for biosynthesis and export of simocyclinone D8 and its precursors. AMB Express – 2012, 2:1. doi: 10.1186/2191-0855-2-1
  50. Horbal L., Zaburannyy N., Ostash B., Shulga S., Fedorenko V. Manipulating the regulatory genes for teicoplanin production in Actinoplanes teichomyceticus. World J. Microbiol. Biotechnol., – 2012. – Vol. 28. – P. 2095–2100. doi: 10.1007/s11274-012-1013-6
  51. Raju R., Gromyko O., Fedorenko V., Luzhetskyy A., Muller R. Pimprinols A-C, from terrestrial actinomycete, Streptomyces Tetrahedron Lett. – 2012. – Vol. 53, Is. 24. – 3009–3011. https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2012.03.134
  52. Ostash B., Rebets Y., Myronovskyy M., Tsypik O., Ostash I., Kulachkovskyy O., Datsyuk Y., Nakamura T., Walker S., Fedorenko V. Identification and characterization of the Streptomyces globisporus 1912 regulatory gene lndYR that affects sporulation and antibiotic production. Microbiology. – 2011. – Vol.157. – 1240–1249. doi: 10.1099/mic.0.045088-0
  53. Myronovskyi M. Welle E., Fedorenko V., Luzhetskyy A. Beta-glucuronidase as a sensitive and versatile reporter in actinomycetes. Appl. Environ. Microbiol. – 2011. – Vol.77, Is.15. – P. 5420–5427. doi: 10.1128/AEM.00434-11
  54. Rabyk M. B. Ostash, Y. Rebets, S. Walker, V. Fedorenko. Streptomyces ghanaensis pleiotropic regulatory gene wblAgh influences morphogenesis and moenomycin production. Biotechnol. Lett. – 2011. – 33, Is.12, Р. 2481–2486. doi: 10.1007/s10529-011-0728z
  55. Klimishin D.A. Rabyk M.V., Gren’ T.P., Nimets’ O.Ya., Gonchar M.A., Gromyko A.N., Fedorenko V.A. Construction of Streptomyces nogalater Lv65 strains with enhanced nogalamicin biosynthesis using regulatory gene. Appl. Biochem. Microbiol. – 2011. – Vol. 47, No. 6. – Р. 594–598. https://doi.org/10.1134/S0003683811060068
  56. Klymyshin D.O., Gren T.P., Fedorenko V.O. Role of the snorA gene in nogalamycin biosynthesis by strain Streptomyces nogalater Microbiology, 2011, Vol. 80, No. 4, pp. 496–501. https://doi.org/10.1134/S0026261711040096
  57. Ostash B., Doud E., Fedorenko V. The molecular biology of moenomycins: towards novel antibiotics based on inhibition of bacterial peptidoglycan glycosyltransferases. Biol. Chem. 2010. – Vol.391, N5. – P.499–504. doi: 10.1515/BC.2010.053
  58. . Ostash B., Ostash I., Zhu L., Kharel M.K., Luzhetskyy A., Behthold A., Walker S., Rohr J., Fedorenko V. Properties of lanK-based regulatory circuit involved in landomycin biosynthesis in Streptomyces cyanogenus. Rus. J. Genet.- 2010. Vol.46,N5.- P.530-535. https://doi.org/10.1134/S1022795410050030
  59. Myronovskyy M.L., Ostash B.E., Fedorenko V.A. Diversity of genes encoding nonribosomal peptide synthetases in the Streptomyces sioyaensis Rus J Genet. – 2010. – Vol.46, N7. – P.794-800. https://doi.org/10.1134/S1022795410070033
  60. Makitrynskyy R., Rebets Y., Ostash B., Zaburannyi N., Rabyk M., Walker S., Fedorenko V. Genetic factors that influence moenomycin production in streptomycetes. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – Vol.37, N6.- P.599-566. doi: 10.1007/s10295-010-0701-1
  61. Horbal L., Rebets Y., Rabyk M., Luzhetskyy A., Welle E., Ostash B., Nakamura T., Fedorenko V., Bechthold A. Characterization and analysis of the regulatory network involved in control of lipomycin biosynthesis in Streptomyces aureofaciens Tu117 // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – Vol.85, N4. – P. 1069-1079. https://doi.org/10.1007/s00253-009-2108-3
  62. Kobylyanskyy A., Ostash B., Fedorenko V. Heterologous cross-expression of oxygenase and glycosyltransferase genes in streptomycetes, producing angucyclic antibiotics. Cytol Genet. 2009; 43(3):194-200. https://doi.org/10.3103/S0095452709030098
  63. Ostash B., Korynevska A., Stoika R., Fedorenko V. Chemistry and biology of landomycins, an expanding family of polyketide natural products. Mini Rev Med Chem. 2009; 9(9):1040-51. doi: 10.2174/138955709788922593
  64. Rebets Y., Boll R., Horbal L., Fedorenko V., Bechthold A. Production of avilamycin A is regulated by AviC1 and AviC2, two transcriptional activators. J. Antibiot. 2009; 62(8):461-4. doi: 10.1038/ja.2009.63
  65. Zaburannyy N., Ostash B., Fedorenko V. TTA Lynx: a web-based service for analysis of actinomycete genes containing rare TTA codon. Bioinformatics. 2009; 25(18):2432-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btp402
  66. Myronovskyy M., Ostash B., Ostash I., Fedorenko V. A gene cloning system for the siomycin producer Streptomyces sioyaensis NRRL-B5408. Folia Microbiol. 2009; 54(2):91-6. doi: 10.1007/s12223-009-0013-x
  67. Ostash B., Makitrinskyy R., Walker S., Fedorenko V. Identification and characterization of Streptomyces ghanaensis ATCC14672 integration sites for three actinophage-based plasmids. Plasmid. 2009; 61(3):171-5. doi: 10.1016/j.plasmid.2008.12.002
  68. Ostash I., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Walker S., Fedorenko V. Coordination of export and glycosylation of landomycins in Streptomyces cyanogenus FEMS Microbiol Lett. 2008; 285(2):195-202. doi: 10.1111/j.1574-6968.2008.01225.x
  69. Ostash I., Rebets Y., Ostash B., Kobylyanskyy A., Myronovskyy M., Nakamura T., Walker S., Fedorenko V. An ABC transporter encoding gene lndW confers resistance to landomycin E. Arch Microbiol. 2008; 190(1):105-9. doi: 10.1007/s00203-008-0367-5
  70. Klymyshin D.O., Hromyko O.M., Fedorenko V.O. Application of intergeneric conjugation of Escherichia coli — Streptomyces for transfer of recombinant DNA into the strain S. nogalater IMET43360 Cytol. Genet. 2007; 41(5): 263–267. https://doi.org/10.3103/S0095452707050015
  71. Ostash I., Ostash B., Walker S., Fedorenko V. Proton-dependent transporter gene lndJ confers resistance to landomycin E in Streptomyces globisporus. Rus. J. Genet. 2007; 43(8): 852–857 https://doi.org/10.1134/S1022795407080030
  72. Rebets Y., Dutko L., Ostash B., Luzhetskyy A., Kulachkovskyy O., Yamaguchi T., Nakamura T., Bechthold A., Fedorenko V. Function of lanI in regulation of landomycin A biosynthesis in Streptomyces cyanogenus S136 and cross-complementation studies with Streptomyces antibiotic regulatory proteins encoding genes. Arch. Microbiol. 2008; 189(2):111-20. https://doi.org/10.1007/s00203-007-0299-5
  73. Baig I., Kharel M., Kobylyanskyy A., Zhu L., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Fedorenko V.A., Rohr J. On the acceptor substrate of C-glycosyltransferase UrdGT2: three prejadomycin C-Glycosides from an engineered mutant of Streptomyces globisporus 1912 DeltalndE(urdGT2). Angew Chem Int Ed Engl. 2006; 45(46):7842-6. http://dx.doi.org/10.1002/anie.200603176
  74. Luzhetskyy A., Fedoryshyn M., Gromyko O., Ostash B., Rebets Y., Bechthold A., Fedorenko V. IncP plasmids are most effective in mediating conjugation between Escherichia coli and streptomycetes. Rus. J. Genet 2006;.42(5): 476–481. https://doi.org/10.1134/S1022795406050036
  75. Rebets Y.V., Ostash B.O., Fukuhara M., Nakamura T., Fedorenko V.O. Expression of the regulatory protein LndI for landomycin E production in Streptomyces globisporus 1912 is controlled by the availability of tRNA for the rare UUA codon. FEMS Microbiol Lett. 2006 Mar;256(1):30-7. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2005.00087.x
  76. Dutko L., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Nakamura T., Fedorenko V. A putative proteinase gene is involved in regulation of landomycin E biosynthesis in Streptomyces globisporus FEMS Microbiol. Lett. 2006; 255(2):280-5. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2005.00085.x
  77. Ostash B.E., Ogonian S.V., Luzhetskiĭ A.N., Bechthold A., Fedorenko V.A. The use of PCR for detecting genes that encode type I polyketide synthases in genomes of actinomycetes. Rus. J. Genet. 2005; 41(5): 473–478. https://doi.org/10.1007/s11177-005-0113-x
  78. Ostash B., Kozarevska I., Fedorenko V. Generation of landomycin D-producing strain Streptomyces globisporus Folia Microbiol. 2005; 50(1):19-23. https://doi.org/10.1007/BF02931289
  79. Luzhetskyy A., Zhu L., Gibson M., Fedoryshyn M., Dürr C., Hofmann C., Hoffmeister D., Ostash B., Mattingly C., Adams V., Fedorenko V., Rohr J., Bechthold A. Generation of novel landomycins M and O through targeted gene disruption. Chembiochem. 2005; 6(4):675-8. https://doi.org/10.1002/cbic.200400316
  80. Zhu L., Ostash B., Rix U.., Nur-E-Alam M, Mayers A., Luzhetskyy A., Mendez C., Salas J.A., Bechthold A, Fedorenko V., Rohr J. Identification of the function of gene lndM2 encoding a bifunctional oxygenase-reductase involved in the biosynthesis of the antitumor antibiotic landomycin E by Streptomyces globisporus 1912 supports the originally assigned structure for landomycinone. J Org Chem. 2005; 70(2):631-8. doi: 10.1021/jo0483623
  81. Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Kushnir S., Fukuhara M., Bechthold A., Nashimoto M., Nakamura T., Fedorenko V. DNA-binding activity of LndI protein and temporal expression of the gene that upregulates landomycin E production in Streptomyces globisporus Microbiology. 2005; 51(Pt 1):281-90. doi: 10.1099/mic.0.27244-0
  82. Luzhetskyy A., Liu T., Fedoryshyn M., Ostash B., Fedorenko V., Rohr J., Bechthold A. Function of lanGT3, a glycosyltransferase gene involved in landomycin A biosynthesis. Chembiochem. 2004; 5(11):1567-70. https://doi.org/10.1002/cbic.200400123
  83. Gromyko O., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Fukuhara M., Bechthold A., Nakamura T., Fedorenko V. Generation of Streptomyces globisporus SMY622 strain with increased landomycin E production and it’s initial characterization. J. Antibiot. 2004; 57(6):383-9. https://doi.org/10.7164/antibiotics.57.383
  84. Ostash B., Rix U., Rix L.L., Liu T., Lombo F., Luzhetskyy A., Gromyko O., Wang C, Braña A.F., Méndez C., Salas J.A., Fedorenko V., Rohr J. Generation of new landomycins by combinatorial biosynthetic manipulation of the LndGT4 gene of the landomycin E cluster in globisporus. Chem. Biol.(Cell Chemical Biology). 2004; 11(4):547-55. doi: https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2004.03.011
  85. Ostash B., Rebets Y., Yuskevich V., Luzhetskyy A., Tkachenko V., Fedorenko V. Targeted disruption of Streptomyces globisporus lndF and lndL cyclase genes involved in landomycin E biosynthesis. Folia Microbiol. 2003; 48(4):484-8. https://doi.org/10.1007/BF02931329
  86. Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Hoffmeister D., Brana A., Mendez C., Salas J.A., Bechthold A., Fedorenko V. Production of landomycins in Streptomyces globisporus 1912 and S cyanogenus S136 is regulated by genes encoding putative transcriptional activators. FEMS Microbiol Lett. 2003; 222(1):149-53. https://doi.org/10.1016/S0378-1097(03)00258-1
  87. Luzhetskiĭ A.N., Ostash B.E., Fedorenko V.A. Intergeneric conjugation Escherichia coli–Streptomyces globisporus 1912 using integrative plasmid pSET152 and its derivatives. Rus. J. Genet. 2001; 37(10): 1123–1129. https://doi.org/10.1023/A:1012344319564

 

Патенти за 2003 – 2018 роки

  1. Спосіб отримання штамів Streptomyces globisporusз підвищеним рівнем біосинтезу ландоміцинів. Патент UA62200A/ Федоренко В.О., Ребець Ю.В., Осташ Б.О., Лужецький А.М. – Заявл. 24.01.2003; Опубл.15.12.2003.- Бюл.№12.
  2. Штам актиноміцетів Streptomyces globisporusSmy622 – продуцент протипухлинного антибіотика ландоміцину Е. Патент UA62200A / Громико О.М., Федоренко В.О. Басілія Л.І. – Заявл. 3.06. 2003; Опубл. 15.04.2004.- Бюл.№4.
  3. Спосіб експрес-виявлення антибіотиків групи ландоміцинів.Патент України 88383 / Осташ Б. О. Осташ І. С., Федоренко В. О., Лужецький А., Бехтольд А. – Заявл. 8.01. 2008; Опубл. 12.10.2009.- Бюл.№19.
  4. Спосіб виявлення антибіотиків тіострептонового ряду.Патент України 91725 / Мироновський М.Л., Осташ Б.О., Осташ І.С., Федоренко В.О. – Заявл. 12.05.2008; Опубл. 25.08.2010, – Бюл. № 16.
  5. Cпосіб біосинтезу тіопептидів.Патент України №94958 / Осташ Б.О., Федоренко В.О., Литвинович О.Р., Громико О.М., Грубський Я.П. – Заявл. 23.02.2009; Опубл. 25.06.2011 – Бюл. № 12.
  6. Спосіб уведення реплікативних та інтегративних плазмід у штам Actinoplаnes teichomyceticus.Патент України №54717  / Осташ Б.О., Забуранний Н.В., Громико О.М., Федоренко В.О. – Заявл. 15.04.2010; Опубл. 25.11.2010, Бюл. № 22.
  7. Спосіб підвищення продукції фосфогліколіпідних антибіотиків.Патент України 63820 / Осташ Б. О., Федоренко В. О., Громико О. М., Уокер-Кане С – Заявл. 09.03.2011; Опубл. 25.10.2011, Бюл. № 20.
  8. Спосіб отримання штамів Streptomyces nogalaterз підвищеним рівнем синтезу ногаламіцину. Патент України 63824/ Климишин Д. О., Федоренко В. О., Громико О. М., Грень Т. П., Німець О. Я. – Заявл. 09.03.2011; Опубл. . 25.10.2011, Бюл. № 20.
  9. Cпосіб доставки реплікативних та інтегративних плазмідних ДНК у клітини штаму Streptomyces echinatus.Патент України на корисну модель № 70091 / Климишин Д.О., Федоренко В.О., Гончар М.А., Колісник Г.В. – Заявл 21.11.2011; Опубл. 25.05.2012, Бюл. № 10.
  10. Спосіб підвищення біосинтезу фосфогліколіпідних антибіотиків.Патент України на корисну модель №  63820 / Осташ Б.О., Федоренко В.О., Громико О.М., Уокер-Кане С. – Заявл. 09.03.2011; опубл. 25.10.2011, Бюл. № 20.
  11. Спосіб отримання штамів Streptomyces nogalaterз підвищеним рівнем синтезу ногаламіцину. Патент України на корисну модель №  69352 / Климишин Д.О., Федоренко В.О., Громико О.М., Грень Т.П., Німець О. Я. – заявл. 09.03.2011; опубл. 25.10.2011, Бюл. № 20.
  12. Спосіб підвищення біосинтезу антибіотиків моеноміцинового ряду.Патент України на корисну модель № 71729 / Рабик М.В., Осташ Б.О., Федоренко В.О.  – заявл. 04.01.2012; опубл. 25.07.2012, Бюл. № 14.
  13. Спосіб підвищення продукції антибіотиків моеноміцинового ряду.Патент України на корисну модель № 79968 / Макітринський Р.П., Осташ Б.О., Федоренко В.О., Ципік О.В. – заяв. 02.11.2012; опубл. 13.05.2013, Бюл. № 9.
  14. Спосіб уведення реплікативних та інтегративних плазмід у штами Amycolatopsis japonicaDSM 44213 і Amycolatopsis Lv 42-5.Патент України на корисну модель № 80307 / Осташ Б.О., Грень Т.П., Федоренко В.О., Тістечок С.І. – заяв. 12.11.2012; опубл. 27.05.2013, Бюл. № 10.
  15. Спосіб продукції ландоміцину А.Патент України на корисну модель № 84651 / Осташ І.С., Осташ Б.О., Федоренко В.О., Зелінський А.А., Лужецький А.М. – заяв. 30.04.2013; опубл. 25.10.2013, Блю. № 20.
  16. Спосіб індукції синтезу нових антибіотиків у актинобактерій Патент на корисну модель №94608 Україна, МПК (2013.01) C12Q 1/01, C12Q 1/02, C12Q 1/04.  / Осташ Б., Горбаль Л., Ющук О., Тістечок С., Мурин А., Федоренко В.; заявник і власник Львівський національний університет імені Івана Франка. – №201483116, заявлено 17 квітня 2014 р., опубл. 25.11.2014, Бюл. № 22.
  17. Спосіб отримання штамів Streptomyces nogalater – надпродуцентів ногаламіцину Патент на корисну модель №118567 Україна, МПК (2017.01) C12Q 1/00. / Климишин Д.О., Федоренко В.О., Скляров О.Я., Громико О.М., Фоменко І.С., Боднарчук Т.І., Гринчишин Н.М.;– № U201702528; заявл. 20.03.2017; опубл. 10.08.2017, Бюл. № 15.
  18. Спосіб уведення реплікативних та інтегративних плазмід у штам Streptomyces sp Патент на корисну модель № 128141 Україна, МПК (2018.01) C12N 15/00 C12P 23/00.. LV 1-48 – продуцент антибіотика юніпероліду А / Тістечок С.І., Громико О.М., Федоренко В.О. – № U201801407; заявл. 13.02.2018; опубл. 10.09.2018, Бюл. № 17.

 

Біографія

Народився 22 вересня 1951 року. У 1973 році закінчив з відзнакою біологічний факультет Львівського університету імені Івана Франка, а у 1979 році – аспірантуру у Всесоюзному науково-дослідному інституті генетики та селекції промислових мікроорганізмів, Москва.

У 1981 році захистив у цьому інституті кандидатську дисертацію.

У 2005 захистив докторську дисертацію в Інституті клітинної біології та генетичної інженерії НАН України, Київ)

З 1979 року працює на кафедрі генетики та біотехнології ЛНУ імені Івана Франка.

У 1979 – 1983 р. асистент, 1984 – 1993 р. – доцент, з 1994 р. – завідувач кафедри генетики та біотехнології.

Вчене звання доцента отримав у 1985 році, а професора – у 2006 році.

У 1988 році під його керівництвом створено НДЛ генетики, селекції та генетичної інженерії продуцентів біологічно активних речовин, а у 1995 році – Колекцію культур мікроорганізмів-продуцентів антибіотиків, яку у 2003 році включено до Державного реєстру наукових об’єктів, що становлять національне надбання України.

Стажувався в Московському університеті, Державному науковому центрі антибіотиків, Москва і Лейбніц-Інституті дослідження природних сполук та інфекційної біології, Єна, ФРН.

Член Ради і Президії Українського товариства генетиків і селекціонерів імені М.І. Вавилова і голова Львівського обласного відділення цього товариства.

Головний редактор журналу «Вісник Львівського університету. Серія біологічна».

Член редколегій журналів «Cytology and Genetics» і «Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів імені М. Вавилова».

Член секції за фаховим напрямом «Біологія, біотехнологія та актуальні проблеми медичних наук» Наукової ради Міністерства освіти і науки України.

Член секції Науково-технічної ради Міністерства освіти і науки України з питань формування та виконання державного замовлення на науково-технічну продукцію за пріоритетним напрямом науки і техніки «Науки про життя, нові технології профілактики та лікування найпоширеніших захворювань».

Член спеціалізованої ради із захисту дисертацій Д 35.246.01 в Інституті біології клітини НАН України, Львів.

Проекти

Науковий керівник держбюджетної теми БГ 46Ф «Нові гени актинобактерій, що контролюють продукцію і стійкість до антибіотиків-інгібіторів синтезу пептидоглікану». Номер державної реєстрації: 0117U001224. Термін виконання: 2017 – 2019.

Нагороди

  • Державна премія України у галузі науки і техніки за 2018 рік за роботу “Біологічно активні речовини мікробного синтезу в новітніх біотехнологіях і сучасному аграрному виробництві”. Указ Президента України 110/2019 від 8 квітня 2019 року.
  • Заслужений професор Львівського університету, 2016.
  • Почесна грамота Кабінету Міністрів України, 2017.
  • Відмінник освіти України, 2011.
  • Почесна грамота Міністерства освіти і науки України, 2002.
  • Грамота Міністерства освіти і науки України, 2010.
  • Грамота департаменту освіти і науки Львівської обласної державної адміністрації, 2013.
  • Подяки ректора ЛНУ імені Івана Франка, 2001, 2008, 2011.
  • Подяки від департаменту освіти і науки Львівської обласної держадміністрації, Національного центру «Мала академія наук України», дирекції Всеукраїнського науково-технічного конкурсу «ІNTEL EKO Україна 2016» за підготовку переможців конкурсів науково-дослідницьких робіт школярів.

Методичні матеріали

  1. Федоренко В.О., Осташ Б.О., Гончар М.В., Ребець Ю.В. Великий практикум з генетики, генетичної інженерії та аналітичної біотехнології мікроорганізмів. Навч. посібник– Львів: Видавн. центр ЛНУ імені Івана Франка, 2007. – 279 с.
  2. Федоренко В.О., Черник Я.І., Максимів Д.В., Боднар Л.С. Задачі та вправи з генетики: Навч. Посібник.  – Львів : Оріяна-Нова, 2008. – 598 с.

Розклад

Сторінка розкладу викладачів не знайдена!