Опис курсу

Вибухоподібне зростання даних про первинну структуру генетичного матеріалу усіх форм життя відкриває нові можливості до виявлення родинних та еволюційних зв’язків між ними. Молекулярна філогенетика – наукова дисципліна, що вивчає такі зв’язки на основі даних про нуклеотидні чи амінокислотні послідовності. Сьогодні методи молекулярної філогенетики знайшли своє практичне застосування у низці галузей людської діяльності, що спонукало до розроблення цього курсу, який названо відповідно – “прикладна молекулярна філогенетика”. Ця навчальна дисципліна охоплює сучасні уявлення та методологічні підходи до реконструкції філогенетичних зв’язків (побудови філогенетичних дерев) між видами чи окремими генами/білками й геномами на основі нуклеотидних чи амінокислотних послідовностей. В основі – сучасні концепції молекулярної еволюції, що пояснюють фізико-хімічну логіку розвитку живої матерії на Землі; методологічні підходи до кількісної оцінки філогенетичних відносин на основі молекулярно-генетичних даних. У першій частині курсу буде розглянуто теоретичні засади філогенії та їхнє застосування на рівні генетичних послідовностей. У другій частині, курсу на основі вибраних прикладів буде розглянуто прикладні аспекти філогенетичної реконструкції у галузях біотехнологій, систематики, охорони природи, епідеміології, медицини та криміналістики.

Після курсу студент буде: а) розуміти сутність і відмінності різних алгоритмів філогенетичної реконструкції; б) створювати, відбирати і курувати масиви даних для філогенетичного аналізу; в) розуміти зміст і важливість, що їх несуть різні елементи філогенетичного дерева; г) вміти створювати філогенетичні дерева на основі різних масивів даних за допомогою різних програмних знарядь та веб-сервісів; д) розуміти значення і цінність філогенетичної реконструкції у таких галузях як ідентифікація видів, епідеміологія, криміналістика, біотехнологія.